ChIP(染色质免疫共沉淀)是检测体内条件下DNA与蛋白质相互作用的方法,采用特异性抗体将目的蛋白进行免疫沉淀,由此可以把目的蛋自所结合的基因组DNA片段也富集下来。ChIP-qPCR可以对目的片段进行定量分析,通过对目的序列的扩增,并与Input、阳性对照和阴性对照的量对比,就可以证明目的蛋白是否与预想的DNA序列发生了相互作用...
ChIP-Seq互作组验证,即在互作组分析筛选的基础上,进一步利用ChIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测,更加精细,也是互作组验证的必由之路。成功验证上岸的基础是理想的互作组数据库和丰富的分析经验,方能事半功倍。广州基云生物,在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力互作机制研究。如有...
ChIP-qPCR 数据需要针对可变性来源进行标准化,包括染色质数量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。 两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和富集倍数法(Fold Enrichmen)。与input相关的ChIP-qPCR数据包括ChIP的背景水平和input染色质的标准化。建议ChIP 实验重复,尽可能将结果与背景信号和标准...
因此,ChIP-Seq是研究细胞内蛋白/DNA互作调控网络的常规前置技术。 ChIP-qPCR是一种检测细胞内蛋白/DNA互作的靶向验证技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和qPCR检测技术,对目的蛋白在特定细胞/组织内的蛋白/DNA互作关系进行探究,验证蛋白/DNA的相互作用关系。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/DNA互作验证,...
在该步骤中,通过qPCR定量纯化的DNA产物,通过qPCR,您可以确定目标蛋白是否存在于特定位点。 ChIP的qPCR如何定量分析 ChIP-qPCR 数据需要针对可变性来源进行标准化,包括染色质数量、免疫沉淀的效率(富集效率)和 DNA 回收率。 两种常用的标准化 ChIP-qPCR 数据方法——Percent Input法和富集倍数法(Fold Enrichmen)。与in...
技术方法:ChIP-seq、RNA-seq、RT-qPCR等 作者通过对小鼠体细胞重编程过程中进行转录组和ChIP-seq等测序分析,揭示了H3K27me3去甲基化酶JMJD3与KLF4在体细胞重编程中协同调控转录新机制。首先,JMJD3对重编程有2方面相反的作用;在机制上,JMJD3被KLF4特异性地招募...
技术方法:ChIP-seq、RNA-seq、RT-qPCR等 作者通过对小鼠体细胞重编程过程中进行转录组和ChIP-seq等测序分析,揭示了H3K27me3去甲基化酶JMJD3与KLF4在体细胞重编程中协同调控转录新机制。首先,JMJD3对重编程有2方面相反的作用;在机制上,JMJD3被KLF4特异性地招募至上皮和多能性基因位点,并辅助KLF4激活这些基因。进...
技术方法:ChIP-seq、RNA-seq、RT-qPCR等 作者通过对小鼠体细胞重编程过程中进行转录组和ChIP-seq等测序分析,揭示了H3K27me3去甲基化酶JMJD3与KLF4在体细胞重编程中协同调控转录新机制。首先,JMJD3对重编程有2方面相反的作用;在机制上,JMJD3被KLF4特异性地招募至上皮和多能性基因位点,并辅助KLF4激活这些基因。进...
ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证技术价值:(1)蛋白与DNA相互作用数据,是探究转录调控机制研究的重要内容,...
技术方法:ChIP-seq、RNA-seq、RT-qPCR等 作者通过对小鼠体细胞重编程过程中进行转录组和ChIP-seq等测序分析,揭示了H3K27me3去甲基化酶JMJD3与KLF4在体细胞重编程中协同调控转录新机制。首先,JMJD3对重编程有2方面相反的作用;在机制上,JMJD3被KLF4特异性地招募至上皮和多能性基因位点,并辅助KLF4激活这些基因。进...