ChIP-qPCR是一种研究细胞内蛋白与DNA相互作用的检测技术。它结合了免疫共沉淀和qPCR方法,旨在揭示目的蛋白在特定细胞或组织中与DNA的结合情况。通过此技术,科学家可以验证蛋白与DNA的相互作用,并应用于研究特定细胞或组织中蛋白-DNA互作的验证,以及不同遗传背景或实验条件下互作的差异。ChIP-qPCR在研究细...
ChIP-PCR 可用来分析基因组中一部分已知靶标位点上的组蛋白修饰和/或蛋白结合情况。在ChIP-PCR中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂和技术可检测和定量免疫富集的 DNA 片段。使用 ChIP-qPCR 可以对多种样品中的特定基因组区域进行快速和定量比较。这比全基因组测序方法更便宜,更省时。 5.2 ChIP-芯片(ChIP-chip)...
染色质免疫共沉淀(ChIP)是一种研究蛋白质与DNA相互作用的技术。它通过将蛋白质-DNA复合物交联固定,随机打断染色质,利用免疫学方法富集带有目标蛋白的复合物,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。ChIP结合实时荧光定量PCR(ChIP-qPCR)用于检测蛋白质与特定位点DNA的结合强度;与基因芯片结合的ChIP-on-ch...
ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证技术价值:(1)蛋白与DNA相互作用数据,是探究转录调控机制研究的重要内容,...
(3)DNA分析 qPCR是很好的方法检测可能的结合位点; 引物设计主要在启动子区域,一般针对基因前100-500bp,设计涵盖启动子区域的多个引物,常用的软件有MEME、ECRBrowser。 CHIP用时较久,一般要3天,中间步骤复杂,得到好的结果不容易,需要反复预实验。
什么是ChIP实验? 染色质免疫沉淀实验(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP), 是研究核酸与蛋白质相互作用的经典实验。DNA分子与目的蛋白分子结合,加入对应抗体识别目的蛋白,进一步把DNA分子共同沉淀下来。下游可通过qPCR技术证明其相互作用,或者通过测序技术寻找目的蛋白的潜在DNA结合序列。
[EMSA/Ch ] ChIP-qPCR引物设计 20 (3/3598) Lucasssssss 2019-02-26 2020-05-24 21:09:19 by 猪妹妹May [EMSA/Ch ] 求虫友们推荐靠谱的酵母单杂公司 10 (3/593) Yxijaier 2017-12-27 2020-05-19 20:39:52 by hsk129 [EMSA/Ch ] 求大神告知pulldown和酵母单杂有何区别 (2/1142) 樊虫...
ChIP-Seq 有什么样品要求? 1) 请提供浓度≥10 ng/ul、总量≥20 ng、OD260/280 为1.8~2.2 的DNA 样品;若单次ChIP 后DNA 量不够,建议将2~3 次ChIP 的DNA 合并在一起。 2)请提供DNA 打断时检测胶图,要求打断后DNA 电泳主带在100-500bp 范围内;请对于ChIP 获得 DNA 设计引物进行QPCR 验证和定量,能够...
CUT&RUN的主要步骤:细胞通透化——加入目的蛋白抗体(特异性的结合在目的蛋白处)——招募和protein A/G偶联的微球菌核酸酶(pA/G-MNase)——加入Ca2+激活MNase活性,切割目标区域的DNA——回收片段化的DNA——qPCR检测或NGS建库测序。 图1:CUT&RUN实验原理 ...