在 ChIP-PCR 或 ChIP-seq 中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂和下一代测序 (NGS) 技术便能检测和定量免疫富集的 DNA 片段。ChIP 可以用来回答大量涉及蛋白和染色质相互作用的科学问题。例如,ChIP 可用来比较某些蛋白在各位点上的存在情况,绘制某个目的基因组区域内的各种蛋白图,或定量能够在受到刺激一段时间后...
RIP又叫RNA免疫沉淀,利用抗原A与RNA B结合,抗原A的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化对RNA进行测序或PCR分析,就可以获得RNA与蛋白相互作用的信息。 CHIP又叫染…
RNA结合蛋白免疫沉淀技术(RNA Binding Protein ImmunoprecipitationAssay,RIP)主要是用来研究体内、RNA与蛋白结合情况,利用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,通过分离纯化,对结合在复合物上的RNA 进行RT-PCR验证或测序分析。 六、RNA pull down实验 顾名思义,是研究RNA与蛋白质相互作用的一种技术。利用...
5.DNA纯化和分析：纯化DNA，并通过PCR、qPCR、ChIP-seq等方法分析DNA序列，确定蛋白质的结合位点。应用 ...
【结论】:作者使用ChIP-PCR的方法证明了Egr-1蛋白可与hPar1 promoter结合 【分组解释】 Input组:全细胞裂解液,含有细胞内所有的DNA,可认为是本底组(阳性组); Egr-1 Ab组:目标蛋白一抗拉取组,这里显示的都是与目标蛋白有结合的DNA片段; IgG组:IgG抗体拉取组,为阴性对照组。
除了做验证实验外,ChIP DNA也可进行测序分析和芯片分析,测序分析对应的方法是染色质免疫共沉淀(ChIP-SEQ);芯片分析对应的方法是ChIP-on-chip。 这两种方法都可以用于分析目的蛋白结合的未知序列。 1、实时定量 PCR 用比较精确的实时定量PCR方法检测沉淀的DNA样品,称为实时定量染色质免疫共沉淀技术(qChIP)。这种方法...
(1)ChIP-qPCR (染色质免疫共沉淀定量PCR): 原理:通过特异性抗体捕获与DNA结合的蛋白质,然后通过qPCR定量特定区域的富集程度。 应用:验证ChIP-seq数据中的特定结合位点,或者在没有进行全基因组测序的情况下,检测特定区域的蛋白质-DNA相互作用。 (2)Co-IP (共免疫沉淀): ...
便于DNA纯化和分析:较小的DNA片段更容易从蛋白质中分离出来,便于后续的DNA纯化和分析,如PCR、测序或微阵列分析。 提高实验效率:适当的染色质片段化可以提高ChIP实验的效率,因为较小的片段更容易被处理和分析,从而减少了实验操作的复杂性和时间。 9、超声法和酶解法的区别?
萤光素酶报告基因系统和CHIP都可以检测蛋白质与DNA的相互作用，那么它们之间有什么区别呢？