接着作者用两个正常人与两个患者的外周血 scRNA-seq 解析了CTL的减少。聚类后11个细胞簇,根据marker,作者将11个簇定义为11种细胞,簇1是CTL。瘢痕疙瘩患者的CTL数量低于健康供体。CTL被分成五个簇(子簇0-4),亚群0强烈富含 GZMB...
接着作者用两个正常人与两个患者的外周血 scRNA-seq 解析了CTL的减少。聚类后11个细胞簇,根据marker,作者将11个簇定义为11种细胞,簇1是CTL。瘢痕疙瘩患者的CTL数量低于健康供体。CTL被分成五个簇(子簇0-4),亚群0强烈富含 GZMB、 TBX21和 KLRG1等标记基因,代表 CTL 减少。 接下来,作者分析了34例瘢痕疙瘩患者...
CTL被分成五个簇(子簇0-4),亚群0强烈富含 GZMB、 TBX21和 KLRG1等标记基因,代表 CTL 减少。 接下来,作者分析了34例瘢痕疙瘩患者和36例健康供者之间在CTL谱系里,前10的差异表达基因。除了 CTL 的marker,以下几个基因值得关注,PBMC 中 CD3 + CD8 + HOPX + T (由 HOPX 基因编码的 HOPX)和 CD3 + CD8 +...
图2:PD-1+ CD8+T细胞marker表达 4. PD-1+ CD8+ T细胞克隆扩增 ALS4小鼠模型脑组织中分选出PD-1+ CD8+ T细胞及PD-1- CD8+ T细胞并对其进行TCR受体测序,发现PD-1+ CD8+ T细胞克隆扩增能力增强,即大量T细胞克隆同一片段的TCR;且在脊髓及外周血中有类型表现...
由于scRNA-seq数据显示,CX3CR1在表达Gzmb、Ifng和Gzma等杀肿瘤基因的Ib-CD8+ T细胞中表达,通过实验验证进一步证明,CX3CR1可被MHC Ia诱导,是具有杀瘤潜能的Ib-CD8+ T细胞的marker基因。 对携带肿瘤的WT小鼠的CD8+ T细胞的scRNA和scTCR分析,结果显示,CX3CR1+ CD8+ T细胞确实存在于WT小鼠中,并且高表达细胞毒性...
这些结果指向了TAM和Tex之间的相互依赖性(Figure 6H)。与此一致,作者还发现耗竭marker表达与巨噬细胞成熟之间的正相关关系,而单核细胞中抗原呈递相关基因的表达随单核细胞向内移动而不断降低(Figure 6I)。这些数据支持了一个模型,即单核细胞向内移动并向末端TAM分化时下调抗原呈递,同时T细胞耗竭状态发展。
如果你使用上面的基因列表,你会发现主要的naive状态的是CD4的T细胞,其它主要是CD8的T细胞。 然后是: naive T cell, such as CCR7, LTB, and SELL memory CD4+ T cells (TEM) CXCR4, TNFRSF4, and CCR6, RORA, IL6ST, and IL17RA, suggesting a TH17 cell identity ...
发现在CSF的T细胞中主要是CD8+T细胞发生克隆扩增,其中一位AD患者的存在大量扩增的克隆,占CD8+ T细胞的44%(图3b)。随后Marker基因鉴定发现该克隆为CD8+ CD45RA + CD27- TEMRA细胞(图3c)。这项发现首次提出了受年龄相关神经退行性病变影响的大脑脑脊液中存在克隆扩增的CD8+ T细胞。 研究者使用drop-seq对CSF细胞...
荷瘤宿主(T)和感染宿主(E)中的T细胞都经历了非常强劲的细胞分裂(60小时内分裂6个以上), 激活marker CD69和CD44表达上调,图1b,c。 E-TCRTAG和T-TCRTAG均上调LAG3和PD-1,反映激活的TCR信号; 注:SV40是猴空泡病毒40,猿猴病毒40或猴病毒40的缩写,多瘤病毒科,这是在人类和猴子都发现的致瘤病毒。是一类个体...
Fig 1. 基于TCR序列的CD8+ T细胞scRNAseq鉴定血液中MC38 TM克隆 2、通过流式细胞术发现血液中TM CD8+T细胞的转录特征可用于鉴定富集标记 为了测试单基因的表面marker是否可以识别TM细胞成分,研究者开发了COMET计算工具来从单细胞转录组结果中预测marker基因,并鉴定到了82个候选阳性标记。并通过CITE-seq验证了CD39、...