我们再严格分析一下254个基因在Cancer5000 set,得到219 distinct genes.叫做Cancer5000-S (for ‘stringent’) gene。 Cancer Gene Census (CGC)组织的 (v65)版本包含着130个cancer genes driven by somatic point mutations,其中82个被我们这次统计分析发现啦。 Four genes encode anti-proliferative proteins, in ...
被引量: 0发表: 2020年 基于基因网络模型分析的癌症驱动基因识别算法研究 并且预测结果与癌症基因普查(Cancer Gene Census,CGC)数据库的重叠比例能够达到40%及以上,均优于现有的先进方法.进一步的分析也表明,整合网络特征有利于癌症驱动基因... 戴耀 被引量: 0发表: 2020年 加载更多来源...
通过对各种癌症进行调研,整理了一份癌症相关的突变基因列表,这份列表就是Cancer Gene Census,简称CGC。这里又分为三个子菜单Census、Breakdown(统计分析)、Abbreviations,其中Census菜单,显示目前所有的癌基因,而且这个数据表可以搜索,导出(需要先注册)。 在CGC种,将所有的癌症相关基因分成两类,(1)Tier1:基因必须具有...
在数据库的前端,我们已经实现了许多图形算法来操作有符号的定向“癌症图”,以帮助完成以下任务:(i)确定将任何给定基因与癌症标志表型联系起来的路径,(ii )给定一个明显不相关的肿瘤相关基因列表,如在 CGC 或 DisGeNET 中,通过因果关系将它们连接起来,(iii)给定任何用户定义的基因列表,通过因果关系将它们连接起来,并...