目录 收起 一、比赛场景:生存分析 二、C-index评估指标 三、baseline 这是Kaggle新出的算法比赛:CIBMTR - Equity in post-HCT Survival Predictions。这是在MCTS之后的又一次表格赛,我争取这次拿银牌。 由于这次比赛的场景以及比赛的评估指标都是我陌生的,所以就花时间学习一下,并在这里进行记录。 参考资料:...
时间依赖性(time-dependent)的C-index是一种对生存分析模型预测能力进行评估的指标,旨在解决传统C-index中忽略了风险组成变化和随时间改变的问题。与传统C-index只考虑患者之间的事件顺序不同,时间依赖性的C-index通过考虑患者的风险状态的变化,将权重加在有风险的时段内,反映出模型在不同时间点上的预测准确性。 在...
# 这里的Concordance就是C指数,为0.565 # 验证集c-index和95%CI # 这里中间的环节是使用predict函数去预测test数据集中每个样本的风险值 # 然后将得到的每个样本的风险值再进行coxph拟合成一个新的函数 # 最后使用predict(Ctrain, newdata = test)计算的风险评分作为一个新的自变量来拟合Cox模型 Ctest <- coxp...
R语言潜类别分析 r语言cindex roc曲线和cindex曲线属于一致性的指标。后台有粉丝问怎么绘制cox回归中的时间相关性roc曲线和时间相关性cindex曲线,今天来演示一下。 我们先导入数据和R包 library(survival) library("survminer") library(foreign) bc <- read.spss("E:/r/test/Breast cancer survival agec.sav",...
C-index,又称C指数,一致性指数(index of concordance),主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度(discrimination),也称为Harrell's concordance index ,与ROC曲线的AUC作用类似;在评价肿瘤患者预后模型的预测精度中用的比较多。本质上是估计了预测结果...
主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的符合程度,以评价模型的预测准确性。常用在评价患者预后模型的预测精度中。理论上,C-index取值范围是[0.5-1]:Cindex=0.5表示预测与实际完全不一致,说明该模型没有预测作用;C-index=1表示该模型预测...
分享一篇备受瞩目的高分meta分析研究成果，探讨心血管疾病风险预判中的核心指标——C-index。该研究发表于2021年9月，出自《JACC: Cardiovascular Imaging》杂志，影响因子达到14.6，位于Q1级别。研究背景指出，心血管疾病诊断和风险评估除了临床因素，生物标志物检验技术的进步尤为重要。本文针对血管炎症生物...
C-index,英文名全称concordance index,中文里有人翻译成一致性指数,最早是由范德堡大学(Vanderbilt University)生物统计教教授Frank E Harrell Jr1996年提出,主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度(discrimination),和大家熟悉的AUC其实是差不多的;在评价肿瘤患者预后模型的预测精度中用的比较多。一般...
C-index简介 C-index又称C指数,一致性指数(index of concordance),主要用于计算生存分析中的Cox模型预测值与真实之间的区分度(discrimination),也称为Harrell's concordance index ,与ROC曲线的AUC作用类似;在评价肿瘤患者预后模型的预测准确性中用的比较多。
C-index，英文名全称concordance index，中文里有人翻译成一致性指数，最早是由范德堡大学（Vanderbilt University）生物统计教教授Frank E Harrell Jr 1996年提出，主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度（discrimination），和大家熟悉的AUC其实是差不多的；在评价肿瘤患者预后模型的预测...