目录 收起 一、比赛场景:生存分析 二、C-index评估指标 三、baseline 这是Kaggle新出的算法比赛:CIBMTR - Equity in post-HCT Survival Predictions。这是在MCTS之后的又一次表格赛,我争取这次拿银牌。 由于这次比赛的场景以及比赛的评估指标都是我陌生的,所以就花时间学习一下,并在这里进行记录。 参考资料:...
时间依赖性(time-dependent)的C-index是一种对生存分析模型预测能力进行评估的指标,旨在解决传统C-index中忽略了风险组成变化和随时间改变的问题。与传统C-index只考虑患者之间的事件顺序不同,时间依赖性的C-index通过考虑患者的风险状态的变化,将权重加在有风险的时段内,反映出模型在不同时间点上的预测准确性。 在...
C-Index,也叫一致性指数,是Cox回归模型评价中最为重要的参数之一,反映了模型预测效果的优劣,是衡量模型区分度的重要参数,主要用于计算生存分析中COX模型预测值与真实值之间的区分度。本文介绍几种计算Cox回归模型C-index的几种方法。 1、加载R包 rm(list = ls()) library(rms) library(survival) library(pec) ...
KMsurv包的中文名字：基于Klein和Moeschberger（1997）的生存分析数据集说明书 Package‘KMsurv’October12,2022 Version0.1-5 Date2012/12/03 Title Data sets from Klein and Moeschberger(1997),Survival Analysis Author Original by Klein and Moeschberger,modifications by Jun Yan <***> Maintainer Jun Y...
紧张的期中考试已经结束,学生们在收获希望的同时,老师们也在总结反思,以便更好地改进教学。 秋风起,雁南飞。 秋气堪悲未必然,清寒正是可人天。 11月15日上午三四节课,初中部语文组全体教师在王校长、赵主任的带领下,在三楼教工之家对期中水平测试进行了质量分析。力图明确现状,如实地评价前半学期教学质量的好...
下面来介绍一下时间先关性cindex,这个需要使用到pec包,先画f1的 library(pec) A1<-pec::cindex(list("f1"=f1), formula=Surv(time,status)~er+histgrad+pr+age+ln_yesno, data=bc, eval.times=seq(3,132,1)) plot(A1) 假设想了解f1、f、f3先关性cindex A1<-pec::cindex(("f1"=f1,"f2"=...
Concordance index (C-index) 首先看C指数,这个一致性指数在分类结局的预测模型中给大家提到过,就是ROC曲线下面积,对于生存数据的预测模型来讲,这个指数和灵敏度特异度就没关系了,它比的是实际值和预测值的排序一致不一致。理解方法可以参考秩和检验。
生存机器学习知多少 | 生存机器学 习预测模型你了解多少 | 生存机器学习模型,常用的包括RSF、XGBoost、GBM、LASSO、SVM、COX、Rpart、Deepsurv等,分别建模后,比较其在测试集上的时间AUC曲线、ROC曲线、时间Brier Score、校准图、DCA曲线、C-index等,如果你有数据但是不会这些预测模型,可以了解下统计分析服务。#生存...