BS-seq(Bisulfite Sequencing)是一种用于测序DNA中甲基化修饰的方法。甲基化是一种常见的DNA碱基修饰形式,它在基因组的表观遗传调控中起着重要的作用。BS-seq通过将DNA暴露于亚硫酸盐的处理下,将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(T),而甲基化的胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)不受影响。随后,通过高通量测序技术...
研究DNA甲基化是当今表观遗传学的热点之一。全基因组重亚硫酸盐测序（Whole genome bisulfite sequencing, WGBS/BS-seq）是DNA甲基化研究的金标准。今天就跟着伯小远一起学习一下DNA甲基化以及BS-seq技术是如何运用到植物DNA甲基化研究的吧。1 DNA甲基化的定义 DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的催化下，以S-腺苷甲...
研究DNA甲基化是当今表观遗传学的热点之一。全基因组重亚硫酸盐测序(Whole genome bisulfite sequencing, WGBS/BS-seq)是DNA甲基化研究的金标准。今天就跟着伯小远一起学习一下DNA甲基化以及BS-seq技术是如何运用到植物DNA甲基化研究的吧。 1 DNA甲基化的定义 DNA甲基化是指在DNA甲基转移酶的催化下,以S-腺苷甲...
BS-seq全称是Bisulfite sequencing,其原理很简单,就是原始DNA序列在被亚硫酸盐处理后,未甲基化的C会变成U(随后的DNA复制中变成T),而甲基化的C(包括5mC, 5hmC)则不受改变。这是BS-seq的核心点,之后的序列比对也都是基于此。 3. BS-seq的比对方法 目前有很多BS-seq数据比对的方法,最经典的方法就是BSMAP,参...
亚硫酸氢盐测序(Bisulfite sequencing,BS-seq ,methseq),先使用亚硫酸氢盐处理DNA,然后上机测序来确定甲基化模式。 如果听到 WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing) ,其实也是BS-seq。 1. 原理 用亚硫酸氢盐处理DNA可将胞嘧啶残基(C)转化为尿嘧啶(U),但5-甲基胞嘧啶残基(5mC)对其有抗性,并不会发生转变。
亚硫酸氢盐测序(Bisulfite sequencing,BS-seq ,methseq),先使用亚硫酸氢盐处理DNA,然后上机测序来确定甲基化模式。如果听到 WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing) ,其实也是BS-seq。 1 原理 用亚硫酸氢盐处理DNA可将胞嘧啶残基(C)转化为尿嘧啶(U),但5-甲基胞嘧啶残基(5mC)对其有抗性,并不会发生转变。
其中,酶转化法(enzymatic conversion method,EM-seq)和BS法(Bisulfite sequencing method,BS-seq)是两种主要的甲基化分析方法。它们在原理、适用性、分辨率和复杂性方面有所不同。 🌱 原理: 酶转化法:这种方法利用DNA甲基化敏感的限制酶来区分未甲基化和甲基化的位点。限制酶在未甲基化的CpG位点上结合并切割DNA,...
表观组学测序(Epigenomics Sequencing)是以高通量测序平台为基础,研究基因表达及调控的可遗传变化的技术。根据研究内容可将表观组学分为两类:DNA/RNA的化学修饰和DNA/RNA与蛋白质相互作用。常用的表观遗传学测序方法包括BS-seq和ChIP-seq。 BS-seq DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,获得基因组范围内所有C位点的...
包括甲基化DNA免疫共沉淀测序（Methylated DNA immunoprecipitation sequencing，MeDIP-Seq）、甲基结合蛋白测序（Methyl-binding protein sequencing，MBD-Seq）和重亚硫酸氢盐测序（也称为Bisulfite-Seq，BS-Seq或Methyl-Seq），其中MeDIP-Seq和MBD-Seq都是基于富集的原理，而BS-seq不经过富集可以直接进行测序。重亚硫酸...
因此，亚硫酸氢盐处理引入了依赖于单个C残基甲基化状态的DNA序列的特定变化，从而产生有关DNA片段甲基化状态的单核苷酸分辨率信息，结合高通量测序技术，与参考序列比对即可检测样本DNA甲基化水平。WGBS（Whole-genome bisulfite sequencing），其实也是BS-seq。图 BS-seq检测流程。服务流程 服务流程 客户在线下单——订单/...