BS-seq实验原理 用亚硫酸氢盐（Bisulfite）处理DNA可将胞嘧啶残基（C）转化为尿嘧啶（U），但5-甲基胞嘧啶残基（5mC）对其有抗性，并不会发生转变。因此，用亚硫酸氢盐处理过的DNA仅保留甲基化的胞嘧啶。通过上述原理，对基因组DNA进行亚硫酸盐转换，建库和高通量测序，通过对测序Reads中C-T转换进行分析，即可在...
BS-seq通过将DNA暴露于亚硫酸盐的处理下,将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(T),而甲基化的胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC)不受影响。随后,通过高通量测序技术对DNA进行测序,进而获得每个碱基的甲基化信息。 BS-seq的实验步骤主要分为DNA提取、亚硫酸盐处理、测序建库和测序等几个关键步骤。首先,需要从待测样本...
它可以检测不同样本之间的DNA甲基化差异：包括不同发育阶段的DNA甲基化差异，这对理解发育过程中的表观遗传调控机制至关重要；外部环境因素可以影响DNA甲基化，BS-seq可以帮助我们了解环境因素如何通过甲基化改变基因表达，从而影响植物的生长发育。此外，BS-seq还可以比较突变体与野生型之间的DNA甲基化差异，帮助揭示基因...
BSMAP的原理简单来说可以概括成:由于待比对的reads中的所有未甲基化C都变成了T,所以BSMAP在比对时将参考序列中的所有C都变成T。在比对时,C(reads上的)与T(reference上的)的mismatch实际上就是一个甲基化位点,如果有限度地把这部分mismatch认为成match,那就很容易比对上了。 在对比之前还要考虑下BS-seq用的是什么...
亚硫酸氢盐测序(Bisulfite sequencing,BS-seq ,methseq),先使用亚硫酸氢盐处理DNA,然后上机测序来确定甲基化模式。 如果听到 WGBS(Whole-genome bisulfite sequencing) ,其实也是BS-seq。 1. 原理 用亚硫酸氢盐处理DNA可将胞嘧啶残基(C)转化为尿嘧啶(U),但5-甲基胞嘧啶残基(5mC)对其有抗性,并不会发生转变。
BS-seq即在测序之前使用亚硫酸氢盐处理DNA以确定甲基化水平。其原理主要是，用亚硫酸氢盐处理DNA可将胞嘧啶残基（C）转化为尿嘧啶（U），但5-甲基胞嘧啶残基（5mC）对其有抗性，并不会发生转变。因此，亚硫酸氢盐处理引入了依赖于单个C残基甲基化状态的DNA序列的特定变化，从而产生有关DNA片段甲基化状态的单...
BS-seq技术原理!, 视频播放量 135、弹幕量 0、点赞数 1、投硬币枚数 0、收藏人数 4、转发人数 0, 视频作者 康测科技, 作者简介 ,相关视频:m6A meRIP-seq技术介绍!,ATAC-seq 讲解,绝对定量转录组测序 UMI RNA-seq保姆级介绍,m5C meRIP-seq技术介绍!,m5C bsRNA-seq技
mrnabs seq原理 “mrnabs seq”可能指的是“mRNA-ABS seq”,即“mRNA 绝对定量测序(mRNA Absolute Quantification Sequencing)” ,这是一种结合了高通量测序技术与绝对定量方法的技术,用于精确测定样本中mRNA的绝对表达量。其基本原理如下: 1. 构建带有已知拷贝数的内参RNA。 首先人工合成一系列已知拷贝数、序列不...
BS-seq全称是Bisulfite sequencing，其核心原理是亚硫酸盐处理原始DNA，未甲基化的C会变成U（随后的DNA复制中变成T），而甲基化的C（包括5mC, 5hmC）则不受影响。此过程为BS-seq提供对比对的基础，之后通过比对算法将reads映射到参考序列上。比对方法中，BS-seq使用了BSMAP程序。BSMAP在比对时将参考...