生物过程(bp)、细胞组成(cc)和分子功能(mf)。生物过程(bp)涵盖从基础的代谢途径,如糖酵解过程,每一步反应都涉及多种酶参与,像己糖激酶催化葡萄糖磷酸化,为后续产生能量提供物质基础;细胞组成(cc)包含各种细胞器,线粒体具有双层膜结构,内膜折叠形成嵴,极大增加了呼吸作用相关酶的附着面积;
GO富集分析主要涉及三个分支:生物过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。下面将详细解释这三个分支在GO富集分析中的含义、应用方法,并提供相关的分析步骤、工具推荐及注意事项。 一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的...
1. BP(Biological Process)代表生物过程,涉及基因或蛋白质参与的生物学活动,例如细胞代谢、信号传导等。2. CC(Cellular Component)指的是细胞组成,描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构,例如核内、线粒体等。3. MF(Molecular Function)指的是分子功能,表示基因或蛋白质所具有的化学活性或能力...
BP(BiologicalProcess)、CC(CellularComponent)和MF(MolecularFunction)是基因功能分类的重要概念。BP指生物过程,描述基因或蛋白质参与的生物学活动,如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成,用于描述基因或蛋白质所在位置和结构,如核内、线粒体等。MF指分子功能,表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力...
首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开GO BP、CC、MF三合一双侧条形图绘制页面,左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_GO_term_bp_cc_mf_left_right_bar_plot_191
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换 | 2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析 | 3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果 | 4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示 | 5.GO和KEGG富集分析视频讲解 | 6.KEGG富集分析—柱形图,气
http://www.bioinformatics.com.cn/batch_assign_goid_into_go_term_bp_cc_mf_t019 2, 粘贴待转换的GOIDs 将需要转换的GOID粘贴到必需输入输入框。一行一个GOID,名字必需是GO+冒号+数字串。 3, 提交,并下载结果 粘贴好待转的GOIDs后,点击提交按钮。约3s后,会出现结果页面。
5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。
实现R语言GO分析bp mf cc三合一双侧条形图 摘要 在本文中,我将指导一名刚入行的小白如何使用R语言实现GO分析中的bp(生物过程)、mf(分子功能)和cc(细胞组件)三合一双侧条形图。我将逐步介绍整个流程并提供相应的代码示例,帮助小白顺利完成任务。 流程图 ...
基因本体论(GO)的BP、CC、MF三部分通过条形图清晰展示了富集结果的直观可视化。以下是详细的步骤和关键信息:GO,一个对基因、产物和序列进行结构化描述的工具,划分为MF(分子功能)、BP(生物过程)和CC(细胞组分)三个维度。对于其富集分析结果,通常包含GO术语、基因数量、P值和类别等信息。要创建...