总结来看,BP、CC、MF分别从功能动态性(过程)、空间定位(结构)和分子机制(活性)三个维度解析基因功能。三者结合可全面揭示基因集在生物学系统中的角色,例如某癌症相关基因集可能在BP上富集“细胞增殖”、CC上定位“细胞膜”、MF上具有“激酶活性”,综合提示其通过膜信号转导...
GO富集分析主要涉及三个分支:生物过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。下面将详细解释这三个分支在GO富集分析中的含义、应用方法,并提供相关的分析步骤、工具推荐及注意事项。 一、BP、CC、MF在GO富集分析中的含义 生物过程(BP): 描述生物学上发生的...
1. BP（Biological Process）代表生物过程，涉及基因或蛋白质参与的生物学活动，例如细胞代谢、信号传导等。2. CC（Cellular Component）指的是细胞组成，描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构，例如核内、线粒体等。3. MF（Molecular Function）指的是分子功能，表示基因或蛋白质所具有的化学活性或能力...
基因本体论(Gene Ontology,GO)计划(geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。它被分成三部分:分子功能(Molecular Function,MF)、生物过程(Biological Process,BP)和细胞组分(Cell Component,CC)。 GO功能富集分析结果,一般都会包含至少4列:GO term,基因数,P值和类别。今天给大家...
GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富...
BP指生物过程，描述基因或蛋白质参与的生物学活动，如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成，用于描述基因或蛋白质所在位置和结构，如核内、线粒体等。MF指分子功能，表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力，例如酶催化反应、DNA结合能力。这些术语来自GO框架，在研究中帮助科学家对功能进行注释与分类，并...
生物过程(bp)、细胞膜组(cc)和分子功能(mf)。生物过程、细胞膜组和分子功能是理解生命活动的基础框架。生物过程指细胞内或细胞间发生的一系列有序活动，比如细胞分裂、能量代谢、信号传递。细胞膜组关注细胞膜的结构成分与组织方式，像磷脂层、蛋白质镶嵌的“拼图”。分子功能描述单个分子在生命活动中扮演的角色，...
http://www.bioinformatics.com.cn/batch_assign_goid_into_go_term_bp_cc_mf_t019 2, 粘贴待转换的GOIDs 将需要转换的GOID粘贴到必需输入输入框。一行一个GOID,名字必需是GO+冒号+数字串。 3, 提交,并下载结果 粘贴好待转的GOIDs后,点击提交按钮。约3s后,会出现结果页面。
要创建可视化图，首先，打开一个专门的绘图页面，如bioinformatics.com.cn/p...，页面左侧有导航，中间是输入框和可自定义参数，右侧有示例和描述。从“示例数据”下载Excel格式的资料，其格式应包括：GO term名称、分类（BP、CC或MF）、转化后的P值或FDR、以及基因数。将数据粘贴到输入框，确保数据...