BP(BiologicalProcess)、CC(CellularComponent)和MF(MolecularFunction)是基因功能分类的重要概念。BP指生物过程,描述基因或蛋白质参与的生物学活动,如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成,用于描述基因或蛋白质所在位置和结构,如核内、线粒体等。MF指分子功能,表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力...
1. BP(Biological Process)代表生物过程,涉及基因或蛋白质参与的生物学活动,例如细胞代谢、信号传导等。2. CC(Cellular Component)指的是细胞组成,描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构,例如核内、线粒体等。3. MF(Molecular Function)指的是分子功能,表示基因或蛋白质所具有的化学活性或能力...
1,打开绘图页面 首先,使用浏览器(推荐chrome或者edge)打开GO BP、CC、MF三合一双侧条形图绘制页面,左侧为常见作图导航,中间为数据输入框和可选参数,右侧为描述和结果示例。 http://www.bioinformatics.com.cn/plot_basic_GO_term_bp_cc_mf_left_right_bar_plot_191 图1.可视化页面 2,示例数据 点击右侧“示例...
解释说明: GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差...
要创建可视化图,首先,打开一个专门的绘图页面,如bioinformatics.com.cn/p...,页面左侧有导航,中间是输入框和可自定义参数,右侧有示例和描述。从“示例数据”下载Excel格式的资料,其格式应包括:GO term名称、分类(BP、CC或MF)、转化后的P值或FDR、以及基因数。将数据粘贴到输入框,确保数据...
实现R语言GO分析bp mf cc三合一双侧条形图 摘要 在本文中,我将指导一名刚入行的小白如何使用R语言实现GO分析中的bp(生物过程)、mf(分子功能)和cc(细胞组件)三合一双侧条形图。我将逐步介绍整个流程并提供相应的代码示例,帮助小白顺利完成任务。 流程图 ...
http://www.bioinformatics.com.cn/batch_assign_goid_into_go_term_bp_cc_mf_t019 2, 粘贴待转换的GOIDs 将需要转换的GOID粘贴到必需输入输入框。一行一个GOID,名字必需是GO+冒号+数字串。 3, 提交,并下载结果 粘贴好待转的GOIDs后,点击提交按钮。约3s后,会出现结果页面。
左侧代表显著性,右侧代表基因数,双侧条形图展示GO的3个分类:BP、CC和MF。同时通过AI也可以展示4种甚至更多。, 视频播放量 5177、弹幕量 1、点赞数 36、投硬币枚数 6、收藏人数 106、转发人数 15, 视频作者 微生信课堂, 作者简介 微生信,0代码在线绘制250+科研图,助力科
数据集数据集GSE35257和GSE121190中具有下调功能的差异表达基因 实验组和正常组差异表达基因的火山图 GO分析的BP、CC、MF三合一条形图 肾纤维化中差异表达基因的富集点气泡 肾纤维化中的差异表达基因的水平条形图 差异表达基因建立的PPI网络图 10个中心基因的相互作用图...