bowtie2_manual 下载积分: 2200 内容提示: Site MapHomeNews archiveManualGetting startedFrequently Asked QuestionsTools that use BowtieLatest ReleaseBowtie2 2.1.0 2/21/13 Please cite: Langmead B, Salzberg S. Fast gapped-readalignment with Bowtie 2. Nature Methods. 2012,9:357-359.Related Tools...
Bowtie2-manual (转贴) getting started with Bowtie 2: Lambda phage example-从这里开始使用Bowtie2:λ噬菌体的例子 Bowtie2自带了一些入门级的示例文件,这些示例文件并不具有科学含义,我们用λ噬菌体的参考基因组只是因为它很短,并且例子里面的reads是由一个电脑程序生成的而不是测序的结果。但是,这些文件能让...
Bowtie2: manualTrapnell, Cole
Bowtie的中文意思是:领结,蝴蝶结 Bowtie2是比对软件Bowtie的第二版本,主要改进了支持gap比对。 Bowtie2用户手册: http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 在看比对结果前需要了解三个概念: 1. Aligned concordantly 合理比对 主要和比对参数:--fr/--rf/--ff有关,默认是:--fr 在参数--f...
Bowtie 2 Manual - Table of Contents Introduction What is Bowtie 2? How is Bowtie 2 different from Bowtie 1? What isn't Bowtie 2? What does it mean that Bowtie 2 is "beta"? Obtaining Bowtie 2 Building from source Adding to PATH The bowtie2 aligner End-to-end alignment versus ...
-h/--help print this usage messageBowtie 2: Manualbowtie2 -h ---### bowtie2的版本信息和作者相关信息Bowtie2version 2.2.5 by Ben Langmead(langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)Usage:# bowtie2的基本用法## [options]* 表示可选参数,加上*符号表示可选参数没有个数限制,部分参数...
.net/bowtie2/manualshtml 本文来自http://www.hzaumycology.com/chenlianfu_blog?p=178 如果还有其他问题,请到生物信息问答社区www.BioAsk.net来问问吧这里有来自中科院、国内外高校、公司的生物科研人员以及技术人员,大家一起在线交流 分享到: 查看文档来源:http://www.plob.org/2012/0902/4540html ...
Manual 使用手册 ###Getting started with Bowtie 2: Lambda phage example-从这里开始使用Bowtie2:λ噬菌体的例子 Bowtie2自带了一些入门级的示例文件,这些示例文件并不具有科学含义,我们用λ噬菌体的参考基因组只是因为它很短,并且例子里面的reads是由一个电脑程序生成的而不是测序的结果。但是,这些文件能让你立...
更多详细信息请阅读:http://bowtie-bio.sourceforgenet/ bowtie2/manual.shtml 本文来自:http/.hzaumycology/chenlianfu_blog/?p=178 如果还有其他问题,请到生物信息问答社区.BioAsknet 来问问吧,这里有中科 院、国内外高校、公司的生物科研人员以及技术人员,大家一起在线交流。 分享...
所以,啃文档咯,官方文档Version2.2.9http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml 以下是我的整理。我不生产文档,我只是文档的搬运工么么哒～ Bowtie2适合将长度50-1000bp的reads比对到长的参考序列上。Bowtie 2 indexes the genome with an FM Index ...