1. Conda 安装 conda install -y bowtie2 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) :Conda 安装使用图文详解 2. 传统安装 下载 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml 在Linux系统下将上述的链接下载到本地 代码语言:javascript 复制 s...
conda install -y bowtie2 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) : Conda 安装使用图文详解 传统安装 下载 bowtie-bio.sourceforge.net 在Linux系统下将上述的链接下载到本地 sudo wget https://jaist.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie...
简单记录一下非conda下载安装bowtie2并配置环境 安装好VMware Workstation 并在虚拟机上安装Ubuntu 打开Terminal 打开桌面路径 wget从网络获取bowtie2最新版本(我个人学习的时候安装过2.2,现在安装好的是2.3.5.1,不过现在已经有2.4版本了,区别应该不会很大……) 前面的‘(base)’是下载运行了conda后显示的,正常情况没...
1. Conda 安装 conda install -y bowtie2 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) : Conda 安装使用图文详解 2. 传统安装 下载 ...
conda install -y bowtie2 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) :Conda 安装使用图文详解 2.2 传统安装 下载 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml 在Linux系统下将上述的链接下载到本地 ...
于是在服务器里下载miniconda,并添加了bioconda镜像。(conda安装教程https://www.jianshu.com/p/edaa744ea47d)。conda环境下输入conda iinstall gatk bowtie2。检索结果输入y。 检索后输入“y” 在miniconda/bin目录下输入ls,可以看到bowtie2,输入 ./bowtie2 -help,出现help说明软件就可以用了。
Bowtie2 是一款经典的短读长序列( 50-100 bp,最多可到1000 bp ) 比对软件,支持 单端测序(unpaired) 和双端测序的比对。支持全局比对(end-to-end align ) 和 局部比对( local align )。 Bowie2 安装 Conda 安装bowtie2(需要先装好Anaconda)
conda install -y bowtie2 2.2.传统安装 下载:http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml 在Linux系统下将上述的链接下载到本地 sudo wget https://jaist.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.3.4.1/bowtie2-2.3.4.1-linux-x86_64.zip ...
可以试试：conda install -c bioconda bowtie2