1、下载安装包 sudo wgethttps://jaist.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.3.4.1/bowtie2-2.3.4.1-linux-x86_64.zip 解压后进入安装目录 unzip bowtie2-2.3.4.1-linux-x86_64.zip 2、进入解压文件夹,测试bowtie2是否安装成功:
当参考基因组很长时,这些工具可能会非常缓慢,但当参考基因组很短时通常就足够了。 二、安装 这里提供两种方法,选择一种安装即可,强烈建议使用Conda方式安装 1. Conda 安装 conda install -y bowtie2 这里需要安装Conda (一款用于安装多数生物信息分析软件的管理软件,重要的是可以解决软件的依赖问题) :Conda 安装使...
在 Linux 或 macOS 系统中，可以使用 Conda 进行安装：conda install -c bioconda bowtie2 或从 [Bow...
bowtie2比对软件的安装及参数详解 测序数据分析软件,Bowtie是一个超快的,存储高效的短序列片段比对程序。它能够以每小时处理2500万35bp reads的速度,将短的DNA序列片段(reads)比对到人类基因组上。 一、安装 conda安装 conda install-y bowtie2 传统安装 1、下载源码包 nohup wget https://nchc.dl.sourceforge....
要在Conda环境中安装Bowtie2,你可以按照以下步骤操作: 打开命令行终端: 这可以是你的系统自带的终端(在Linux或macOS上)或Anaconda Prompt(在Windows上)。 输入安装命令: 在终端中,输入以下命令来安装Bowtie2: bash conda install -c bioconda bowtie2 这里,-c bioconda指定了从Bioconda频道安装Bowtie2,因为Bioc...
官网下载安装 官网:http://bowtie-bio./bowtie2/index.shtml Github:https://github.com/BenLangmead/bowtie2/releases 下载对应平台的安装包安装即可。 源码编译安装 官方说明Building from source 至少需要先装好zlib库 输入如下命令 cd~ gitclonehttps://github.com/BenLangmead/bowtie2cdbowtie2 ...
安装飞控固件Bebop 92寻点飞行 西部数据sn850x安装win11 8青岛阿狼电脑装机 ujam虚拟吉他安装 1Sky70音乐工作站 contextcapture 安装 6Khanbalik revit2020安装只有九个产品 0大磊公社 k k模组怎么安装 2财发地毯一站式采购中心 surface可以安装shapr 1CharlieQ sap客户端安装步骤 8SAPB1云课堂 stata16如何安装asdoc...
简单记录一下非conda下载安装bowtie2并配置环境 安装好VMware Workstation 并在虚拟机上安装Ubuntu 打开Terminal 打开桌面路径 wget从网络获取bowtie2最新版本(我个人学习的时候安装过2.2,现在安装好的是2.3.5.1,不过现在已经有2.4版本了,区别应该不会很大……) ...
一、在B站“生信人应该这样学Linux”第5讲-软件安装 Jimmy大神的软件安装教程,留爪慢慢看。 http://www.biotrainee.com/thread-856-1-1.html 1.'\r'是回车,'\n'是换行,前者使光标到行首,后者使光标下移一格。通常用的Enter是两个加起来。 2.tr ":" "\n"是把冒号替换成换行符。
一、bowtie2的安装 使用conda安装 conda install -y bowtie2 使用源码安装 网址:https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/ # 直接下载后解压 wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/bowtie-bio/bowtie2/2.5.1/bowtie2-2.5.1-linux-x86_64.zip ...