blastn -query /path/to/your/query.fasta -db database_alias -out /path/to/your/output.txt 确保将database_alias替换为你之前设置的数据库别名。 通过以上步骤,你应该能够解决“blast database error: no alias or index file found for nucleotide database”错误。如果问题仍然存在,请检查BLAST的安装和...
Local blastp failed: BLAST Database error: No alias or index file found for protein database [...
主要的BLAST程序有以下几种： BLAST的在线版https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi可以方便的进...
建数据库的时候出现如题BLAST Database creation error: Error: Duplicate seq_ids are found，请问是...
[-gi_mask_name gi_based_mask_names] [-out database_name] [-max_file_sz number_of_bytes] [-logfile File_Name] [-taxid TaxID] [-taxid_map TaxIDMapFile] [-version] DESCRIPTION Application to create BLAST databases, version 2.4.0+ ...
额外的算法成分是使用缩小的字母，间隔种子和双索引。算法简单了解一下就可以了，具体的算法的内容比较...
求助,win系统本地blast建库blast16+使用makblastdb建库提示:BLAST Database error: Database memory map file error,大家知道怎么解决吗? 发布于 2024-08-16 19:13・IP 属地河北 本地blast 赞同3 条评论 分享喜欢收藏申请转载 ...
求助,win系统本地blast建库blast16+使用makblastdb建库提示:BLAST Database error: Database m…阅读全文 赞同 3 条评论 分享收藏 makeblastdb 输入多个文件 cliffgao 如果你下载的是一个文件,只要输入以下命令,就可以产生自己的数据库。 makeblastdb -in mydb.fasta -dbtype nucl…阅读...
Blast的运行方式是先用目标序列建数据库（这种数据库称为database，里面的每一条序列称为subject），然后用待查序列（query）在database中搜索，每一条query与database中的每一条subject都要进行双序列比对，从而得出全部比对结果。Blast是一个继承的程序包，通过调用不同的比对模块，blast实现了物种可能的...
[formatdb] ERROR: Failed to create index.Possibly a gi included more than once in the database. 3、如果输入序列不符合FASTA格式或者ASN.1格式,程序会自动退出,并报错: [formatdb] ERROR: Could not open db 4、核酸序列可以用于建核酸库和蛋白库,但是蛋白序列不能用于建核酸库。