特别是当处理较长的序列或大规模的多序列比对时。因此,研究人员通常利用高性能计算和优化算法来加快比对...
首先,可能是因为你的序列与数据库中的参考基因序列完全一致,尤其是在比对到具有高度保守性的基因时。此...
tool)是2018年全国科学技术名词审定委员会公布的生物物理学名词。定义 用于查询序列在全基因组中位置等信息的一种序列比对工具。工作原理不同于基本局部比对检索工具(BLAST)。是将庞大的目标数据库索引化,然后线性搜索查询序列,在时间和空间上数据相关性比较大,速度比BLAST快。出处 《生物物理学名词》第二版 ...
blast序列比对中E值是什么意思? E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或为零时,具本上就是完全匹配了 E-value - this tells you the probability of getting this sco... E value——E(Expect)值,表示随机匹配的可能性。
2楼:Originally posted by厄瑞斯at 2017-11-08 13:23:50 应该是简单重复和低复杂度序列吧。还是有些...
BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序), S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相... BLAST中,E值和P值分别是什么,它们有什么意义? BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。 E期望值(E-value)这个数值表示你仅仅因... 比较低的E值将使搜索的匹配要求更严...
BLASTN比对是一种生物信息学中的序列比较方法,常用于从基因组中识别已知的核酸或蛋白质序列 2楼2023-12-12 21:51 回复 Gig灬mi 初级粉丝 1 这种方法基于全局最邻近匹配算法(Neighbor-joining algorithm),寻找两个序列之间的最佳局部相似性区域进行配对和比较 3楼2023-12-12 21:51 回复 Gig灬mi 初级粉丝 ...
如果本身你的序列是天然序列的话,一种可能是 blast 到一些基因组测序结果。还有可以看下序列覆盖度,有...
首先,这个问题用任何搜索引擎搜一下都能得出答案:什么是双向最佳blast比对,需要进行两次比对吗?_百度...