1.本地BLAST的安装 2.本地BLAST的使用 3.网络版BLAST的使用 一、BLAST简介 1.什么是BLAST BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写,是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序,是目前最常用的数据库搜索程序。 BLAST实际是综合在一起的一...
即建立禾谷镰刀菌的数据库，然后blast找同源序列。二. 本地blast的安装 1.NCBI下载本地版blast [下载...
力旳统计模型来拟定未知序列与数据库序列旳最佳局部联配，可在序列数据库中对查询序列进行 相同性比对工作。7 BLAST简介 BLAST搜索旳六大优点：使用以便，功能齐全速度快，成果可信NCBI精心维护，连续开发配套数据库不断更新免费服务（NCBI、EBI、TIGR）免费下载，本地安装 8 主要旳BLAST程序（功能）程序名BlastnBlastp...
文档简介 Windows下安装和使用BLAST+和一.BLAST+的安装和使用BLAST+的安装①从以下 相应的安装文件ftp://ftp.ncbi.nlm.nih32位的系统ncbi-blast-2.2.28+-win32.exe,64位的系统C盘,路径为:C:\ProgramFiles\NCBI\blast-2.2.28+,blast应用程序的路径为C:\ProgramFiles\NCBI\blast-2.2.28+/bin,该的文件如下:...
安装 直接解压缩包即可。解压缩命令: zcat *.tar.gz | tar xvf - 使用 Blast的运行分为两个步骤:第一,建立目标序列的数据库;第二,做blast比对。 1.运行建库程序formatdb: 建库的过程是建立目标序列的索引文件,所用程序是formatdb。程序允许的输入格式FASTA或者ASN.1格式,通常我们使用FASTA格式的序列作为输入。用...
近年来,进行序列联配分析的工具软件发展了很多,其中,尤以BLAST和FAST A使用最为频繁,一般认为,BLAS T运行速度快,对蛋白质序列的搜寻更为有效,FASTA速度较慢,对核酸序列更为敏感.BLAST是“基本局域联配搜索工具”(Basic Local Alig nment Search Tool)的字头缩写,是最常用的比较核酸和蛋白质同源性的比较工具.现在...
3.1BLAST简介2 3.2BLAST+应用2 4.业务流程及细节3 4.1数据3 4.2使用的方法或解决办法4 4.2.1方法的简单介绍4 4.2.2方法的常见参数以及默认值5 4.2.3备注9 4.3结果解释10 5.实例12 6.参考内容12 1. BLAST是NCBI基本局部比对工具,发现序列之间的局部相似性,这个程序将核酸或者蛋白序列与序列数据库进行比较,计算...
BLAST种类及使用方法
常用生物信息学软件BLAST
对于windows版本，直接在主页http://www.blast2go.com/b2glaunch上，点击here即可下载blast2go的jhlp（jhlp格式介绍：http://www.cnblogs.com/analyzer/articles/871429.html）的安装文件。如下所示。4.3 参考用法 使用手册：http://www.blast2go.com/b2glaunch/resources Documentation and Quick-Start tutorial ...