1.本地BLAST的安装 2.本地BLAST的使用 3.网络版BLAST的使用 一、BLAST简介 1.什么是BLAST BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的缩写,是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序,是目前最常用的数据库搜索程序。 BLAST实际是综合在一起的一...
1. 简介 BLAST(Basic Local Alignment Search Tool),是一套在DNA数据库或蛋白质数据库中进行局部相似性比对分析的工具,其中包括blastn(核酸比核酸),blastp(蛋白比蛋白)和blastx(核酸比蛋白)、tblastn(蛋白比核酸)等工具。 2. 安装 2.1 利用conda安装 conda install blast 2.2官网下载安装包,解压缩后安装 下载:f...
1.下载安装linux版本 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz tar -xzvf ncbi-blast-2.9.0+-x64-linux.tar.gz cd ncbi-blast-2.9.0+/ ./bin/blastp -h 2.使用 先用之前先建库,再比对 #核苷酸建库 makeblastdb -in ref.fasta...
安装本地BLAST包括下载、解压、设置环境变量和查看版本。使用需先格式化数据库，再进行序列比对，参数多样，如-evalue、-num_threads、-perc_identity等。网络版使用则通过网页选择程序、输入序列和搜索数据库。比对结果包括任务描述、高分匹配片段、E值排序、彩色相似度图和比对详细信息。BLAST提供高效、灵活的...
1、程序安装 网站上提供了Windows、Linux、macOS等版本的本地Blast,请下载与自己电脑系统相适应的版本。不知道自己电脑版本的朋友,可以右击“计算机”,选择“属性”查看系统类型。这里我们用ncbi-blast-2.7.1为例。 2、安装流程 下载完成后,双击.exe安装程序的进行安装,默认安装到C盘,但大部分人都不喜欢把软件安装到...
本地BLAST安装与使用说明 一、软件下载以及安装 1.进入NCBI官网 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.点击All Resources 3.Downloads 4.BLAST(Stand-alone) ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 5.根据电脑系统下载相应的安装包(*.exe)...
以下是BLAST安装和使用的步骤：安装部分包括傻瓜版和绿色版的安装。1.1 傻瓜版安装：傻瓜版的安装非常简单，用户只需按照安装向导进行操作即可。1.2 绿色版安装：绿色版的安装需要用户解压下载的压缩包，并将解压出的文件夹移动到预设的安装目录。解压包路径为ncbi-blast-2.14.0+-x64-win64.tar.gz...
blast 本地安装和使用教程 基本局部比对搜索工具 (BLAST) 可查找两个序列之间具有局部相似性的区域。该程序将核苷酸或蛋白质序列与序列数据库进行比较,并计算匹配的统计显着性。BLAST 可用于推断序列之间的功能和进化关系,以及帮助识别基因家族的成员。 下载与安装...
一、软件下载以及安装 1.进入NCBI官网 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 2.点击All Resources 3.Downloads 4.BLAST(Stand-alone) ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 5.根据电脑系统下载相应的安装包(*.exe) 6.双击安装,默认即可 ...