从RNA-Seq层面,我们可以探究哪些基因具有显著差异,上调或下调;从ChIP-Seq层面,我们可以研究某个特定转录因子的调控作用;从ATAC-Seq我们可以了解到染色质可及性的动态变化,由于染色质的可及性与调控元件或转录因子的结合密切相关,在转录调控中发挥着重要的作用。因此,整合分析可以进一步探究调控某一生物学过程的关键因子...
从RNA-Seq层面,我们可以探究哪些基因具有显著差异,上调或下调;从ChIP-Seq层面,我们可以研究某个特定转录因子的调控作用;从ATAC-Seq我们可以了解到染色质可及性的动态变化,由于染色质的可及性与调控元件或转录因子的结合密切相关,在转录调控中发挥着重要的作用。因此,整合分析可以进一步探究调控某一生物学过程的关键因子...
给学徒的ATAC-seq数据实战 - 简书https://www.jianshu.com/p/5bce43a537fd ChIP-seq基础入门 - 简书https://www.jianshu.com/p/a7b6ce208f98 Analysis of single cell RNA-seq data https://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course/index.html 生信技能树公益视频合辑:学习顺序是linux,r,软件安装,geo,...
从RNA-Seq层面，我们可以探究哪些基因具有显著差异，上调或下调；从ChIP-Seq层面，我们可以研究某个特定转录因子的调控作用；从ATAC-Seq我们可以了解到染色质可及性的动态变化，由于染色质的可及性与调控元件或转录因子的结合密切相关，在转录调控中发挥着重要的作用。因此，整合分析可以进一步探究调控某一生...
BETA最初的设计主要是用于ChIP-Seq和RNA-seq的整合分析,最终可以预测特定一个转录因子的靶基因,以及这些基因是激活还是抑制的功能。但是对于ATAC-seq,它得到的信号整个基因组范围转录因子的信号,那么与转录组整合分析得到的结果怎么解释?只能知道一些基因的功能是激活的或抑制的,但是并不能知道这些基因是哪些转录因子的...