8.2 序列比对与BLAST实验(实验操作)(3)是【北京师范大学】分子生物学实验的第48集视频,该合集共计48集,视频收藏或关注UP主,及时了解更多相关视频内容。
BLAST是由NCBI开发的一个基于序列相似性的数据库搜索程序,它将DNA/蛋白质序列与公开数据库所有序列进行匹配比对,从而找到相似序列。 序列相似性比较是将待研究序列与DNA或蛋白质序列库进行比较,用于确定该序列的生物属性,也就是找出与此序列相似的已知序列。完成这一工作只需要使用两两序列比较算法。常用的程序包有BLAS...
在搜索结果中,可以选择“比对”或“BLAST”选项进行序列比对和搜索。 BLAST主要程序包括打开blast、输入比对序列及参数、BLAST结果分析等步骤。一般评价一个blast结果的标准主要有三项,E值(Expect)、一致性(Identities)、缺失或插入(Gaps)。Score、Expect、Identities和Gaps是评价BLAST结果的重要指标,可以帮助我们了解序列的...
应用 怎样进行序列比对? 算法、程序 五、局部序列比对的工具 FASTA BLAST NCBI-BLAST Basic Local Alignment Search Tool 基本局部比对搜索工具(1990) The BLAST algorithm is fast, accurate, and web-accessible. (教材 Page 74) 一、BLAST搜索的基本步骤 1. 选择一个BLAST搜索类型 2. 输入你要查询的序列 3....
它可以在尽可能准确的前提下,快速的从数据库中找到跟某一条序列相似的序列。BLAST 是 Basic Local Alignment Search Tool 的首字母缩写,直译过来就是基本局部比对搜索工具。BLAST 的基本原理很简单,要点是片段对的概念。所谓片段对是指两个给定序列中的一对子序列,它们的长度相等,且可以形成无空位的完全匹配。
不知道你是在什么数据库中比对的，但是一般数据库都会选择比对方式，BLASTN是比对核苷酸、BLASTP是比对蛋白 TBLASTN是蛋白（或者核苷酸）比对核苷酸等等，一般是看BLAST后选择的信息输出方式是核苷酸（RNA/DNA）还是蛋白，如果在NCBI这种通用数据库中一般输出的是基因组DNA信息或者是mRNA对应的cDNA信息 ...
利用Blast进行核酸序列比对的时候,两个序列之间的分值越大,表明这两个序列之间相似度越高。() A. 正确 B. 错误 查看完整题目与答案 当员工“职业化程度高”时,对于领导的替代和中和情况是什么? A. 对于支持型领导是一种中和 B. 对于指导型领导是一种中和 C. 对于支持型领导是一种替代 D. 对于指...
A.Blast可以帮助确定蛋白质序列的保守区域 B.Blast能比对两个药物分子的理化性质 C.Blast可比对多个蛋白质序列的同源性 D.Blast能分析两条不同序列之间的同源性 你可能感兴趣的试题 问答题 商业银行体系的信用创造过程中,其存款货币可以分为() A.原始存款 ...
NCBI Blast结果-菜单与基本信息 1.下一步操作的菜单,你可以调整参数,重新比对、保存你的搜索条件以便下次比对、调整报告显示的参数,以更符合你的要求、下载你比对的结果; 2.此次比对的标题,优先是你填写的,如果没有填写可能是你输入fasta序列头(大于号后面的),如果这个也没有找到,NCBI 会自动生成一个; ...
可采用 ITS4/ITS5 通用引物扩增 ITS 序列,以该菌基因组为模板,通过通用引物 ITS4:5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’ ITS5:5’-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3’ 扩增 ITS4/ITS5 序列,然后测序,(建立系统发育树)把结果拿到 NCBI 上在 GenBank 里进行 Blast 序列比对看与哪类真菌最接近,如果没有则为新的 菌种...