简化基因组测序是指,采取限制性酶切将基因组DNA进行片段化,选择其中的某些特征性片段,利用二代测序技术,可以进行基因组范围内高通量遗传标记的开发和分型。 目前广泛应用的技术是美国Oregon大学发明的RAD技术。但RAD技术存在着两个主要的技术缺陷:1)繁琐的建库流程,其中涉及到多步的DNA分离纯化过程,会对技术重复性、...
欧易简化基因组测序助力性别特异性标记的筛选和表征!2021年11月10日,华东农业大学农业部淡水动物育种重点实验室,农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室高泽霞教授课题组利用2b-RAD技术在Aquaculture(IF:4.242)发表了基于 2b-RAD 和转录组测序的(团头鲂♀×黑尾近红鲌♂)杂交种性别特异性标记的筛选和表征的研究成果。
研究背景:随着基因组时代的到来,研究者可以通过全基因组测序研究物种间的进化关系。但是对于经济价值不高、基因组过大的物种来说,这种方法是不合适的。简化基因组技术,2b-RAD不但经济划算,而且可以在基因组层面提供很多有价值的信息,可应用于分子标记开发、群体遗传、甚至进化研究。 研究内容:美国研究人员采用2b-RAD技...
青岛欧易 2b-RAD简化基因组测序 技术简介 2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶（如BsaXI）对基因组DNA进行酶切，切割位点位于识别位点的左右两侧，酶切后产生等长的33 bp的标签，这些标签经过富集后用于高通量测序，通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。2b-RAD技术流程 技术特点 1. 适用于...
2b-RAD 简化基因组测序 2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33 bp的标签,这些标签经过富集后用于高通量测序,通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。
2b-RAD 简化基因组测序 2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶（如BsaXI）对基因组DNA进行酶切，切割位点位于识别位点的左右两侧，酶切后产生等长的33 bp的标签，这些标签经过富集后用于高通量测序，通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。适用于降解样品、痕量样品（ng级DNA）技术重复性好，标签...
本文是第一个结合2b-RAD和转录组测序方法筛选团头鲂♀×黑尾近红鲌♂杂交种的性别特异性标记研究。 首先,对杂种雌性进行人工诱导雌核发育,发现所有后代均为雌性。然后通过2b-RAD方法检测到两个雄性特异性标签,并通过PCR扩增在杂交种群和黑尾近红鲌种群中进行验证。此后,通过结合转录组测序和定量验证,从基因表达水平...
2b-RAD 简化基因组测序 2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33 bp的标签,这些标签经过富集后用于高通量测序,通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。
2b-RAD 简化基因组测序 2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33 bp的标签,这些标签经过富集后用于高通量测序,通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。
青岛欧易 2b-RAD简化基因组测序 技术简介 2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33 bp的标签,这些标签经过富集后用于高通量测序,通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。