青岛欧易立足生命科学,聚焦基因组学、分子育种、微生物等领域,经过五年的发展,人才队伍更加壮大、团队管理经验更加丰富、技术服务工作更加精准高效。 青岛欧易现拥有2b-RAD、MethylRAD、Super-GBS、LcWGS低深度重测序、2bRAD-M微生物菌群检测五项特色技术,其中2b-RAD技术于2019年被认定为青岛市“专精特新”技术。自成立...
横轴表示染色体的位置:可以看到,不论植物拟南芥还是动物人,采用2b-RAD技术测到的片段(标签)在染色体上分布非常均匀,对于每条染色体长臂、断臂都有足够的覆盖;纵轴表示片段的测序深度,可以看到,这么多条染色体,每个染色体上几千上万的标签,...
经PCR和Sanger测序验证,使用最佳引物成功扩增了九个候选雄性特异性标签中的两个(ref57033–1和ref57066–1),并且在所有雄性中成功扩增了性别特异性412 bp(ref57033–1)和326 bp(ref57660–1)片段,但在2b-RAD测序群体的雌性中未成功扩增(图4A和B)。此外,其他7个雄性特异性标签和5个性别特异性SNP被排除在外,...
1. 采用2b-RAD技术 利用2b-RAD技术对2017-2018年收集的30个C. glaucum个体和120个C. edule个体进行基因分型,采用IIb限制性内切酶AlfI,Illumina 测序平台进行测序。按质量值(Phred值> 30)进行过滤,使用Stacks 2.0进行比对。最终获得了9个SNP位点。2. 采用SNaPshot筛选对选定的SNP进行验证 该方法基于两步扩增反...
简化基因组测序技术,因为其性价比高,一直以来都是基因组层面研究备受关注的技术,2b-RAD简化基因组测序技术于2012年诞生在Nature Methods(IF 23.565),截至目前发文数量超过200篇。 据不完全统计,2022年上半年2b-RAD简化基因组测序技术发文22篇,涉及的应用方向有群体遗传和进化分析、遗传图谱构建和QTL定位、性别分子标记...
2b-RAD:F2和BC群体共528个体,484个体进行2b-RAD测序 技术点睛 1、2b-RAD进行初定位、重测序进行精细定位;2、抗体染色和CRISPR基因敲除进行候选基因的验证。技术路线 主要结论 一、Z染色体定义了次级同域中的物种屏障 对来自美国马里兰州同域群体中的22只雄性 C. eurytheme和Colias philodice(13只橙色UV雄性和9...
2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33 bp的标签,这些标签经过富集后用于高通量测序,通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。 2b-RAD技术流程 技术特点 ...
本文是第一个结合2b-RAD和转录组测序方法筛选团头鲂♀×黑尾近红鲌♂杂交种的性别特异性标记研究。 首先,对杂种雌性进行人工诱导雌核发育,发现所有后代均为雌性。然后通过2b-RAD方法检测到两个雄性特异性标签,并通过PCR扩增在杂交种群和黑尾近红鲌种群中进行验证。此后,通过结合转录组测序和定量验证,从基因表达水平...
2b-RAD测序。挑取致泻性大肠杆菌单菌落接种至2mL胰蛋白胨大豆肉汤中,置于37℃温箱中培养18h;每株阳性菌各吸取200µL送至青岛欧易生物科技有限公司进行2b-RAD测序。 序列分析。利用软件Structure(verison 2.3.4),对所有测序个体进行种群...
2b-RAD:F2和BC群体共528个体,484个体进行2b-RAD测序 技术点睛 1、2b-RAD进行初定位、重测序进行精细定位; 2、抗体染色和CRISPR基因敲除进行候选基因的验证。 技术路线 主要结论 一、Z染色体定义了次级同域中的物种屏障 对来自美国马里兰州同域群体中的22只雄性 C. eurytheme和Colias philodice(13只橙色UV雄性和9...