基于酶切的简化基因组测序(RAD-Seq,Restriction-site Associated DNA Sequence)是对与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA进行高通量测序,可大幅降低基因组的复杂度,降低建库和测序成本,操作简便,同时不受参考基因组的限制,可快速鉴定出高密度的SNP位点,实现遗传进化分析及重要性状候选基因的预测。RAD-Seq尤其适合于大样本...
近年来,简化基因组技术不断发展,呈现出百花齐放,百家争鸣的现象,大家熟知的SLAF-seq技术、基于双酶切的RAD (dd-RND)和GBS (dd-GBS)技术都是简化基因组大家族的重要成员。虽然比不上全基因组测序的波澜状况,但小到分子标记开发,大到遗传辅助育种,遗传图谱构建,基因定位及遗传多样性研究等,简化基因组技术都有它的...
为准确度量狼山鸡保种群体的近交统计量,并比较不同算法在近交统计量度量中的可靠性,研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为研究对象,通过RAD-seq简化基因组测序获得高密度SNP信息,并计算两种分子亲缘系数(kin1和kin2)和四种分子近交系数(...
分化时间较短的物种之间的不完全谱系分选,近缘种之间的杂交以及基因渐渗都会使基因树之间产生冲突,进而对系统发生分析产生影响.锥属(Castanopsis(D.Don)Spach)隶属于壳斗科(Fagaceae),我国约有60种.锥属内一些物种分布面积广,表型变异大,很多物种的分布范围部分或完全重叠,部分种之间杂交可育,加上复杂的种群历史使得...
《利用简化基因组测序（RAD-seq）研究罗浮栲自然群的物种分化》是依托华南农业大学，由孙晔担任项目负责人的面上项目。项目摘要 栲属（Castanopsis）植物是壳斗科常绿阔叶树种，是我国重要的林木种质资源。罗浮栲自然群包括了八种亲缘关系很近，有时难以区分的树种。在这个自然群内，一方面，可能存在的种间基...