10X scATAC-seq(Single Cell Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequecing,单细胞染色质可及性区域的测序)是在单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略。通过单…
10x scATAC-seq(Single Cell Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,单细胞染色质易开放区域测序)基于GemCode微流体平台,利用Tn5转座酶切割染色质的开放区域,并加上测序引物进行高通量测序,以高分辨率研究染色质开放区域,为成千上万个单细胞提供全面的染色质调控图谱。 实验建库流程 ...
10X单细胞ATAC测序,10X scATAC-seq(单细胞染色质可及性区域的测序)是在单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略,北京果壳生物科技有限公司
通过LSI,以与处理 scATAC-seq 数据集相同的方式处理 DNA 可及性。 DefaultAssay(pbmc) <- "ATAC" pbmc <- FindTopFeatures(pbmc, min.cutoff = 5) pbmc <- RunTFIDF(pbmc) pbmc <- RunSVD(pbmc) 5.注释细胞类型 将使用 Hao 等人 (2020) 的带注释的 PBMC 参考数据集,可以从这里下载:atlas.fred...
10x scATAC-seq(Single Cell Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,单细胞染色质易开放区域测序)基于GemCode微流体平台,利用Tn5转座酶切割染色质的开放区域,并加上测序引物进行高通量测序,以高分辨率研究染色质开放区域,为成千上万个单细胞提供全面的染色质调控图谱。
10X单细胞ATAC测序服务详解10X scATAC-seq技术作为单细胞表观基因组学领域的重要工具，通过高通量测序手段，为我们揭示单个细胞中染色质的可接近性，从而深入理解细胞状态及其调控网络。这一策略的重要性在于，它不仅构建了细致的染色质结构图谱，还为疾病的诊断和治疗提供了新的视角。技术优势方面，10X ...
10× Genomics 单细胞 ATAC(scATAC-seq) 可同时满足表观遗传学研究与高通量细胞捕获的需求,在单细胞水平揭示细胞核内染色质可及性的差异, 还能够鉴定细胞类型特异的转录因子,深入研究基因调控网络,进一步分析可以预测转录因子结合位点,推测染色质调控活性,从而在系统发育,疾病发生等 重要生物学过程中揭示细胞在表观遗传...
单细胞组学数据,例如转录组(scRNA-seq),表观组(scATAC-seq)记录了细胞间的分子水平的差异性和相互作用,使生物学家得以深入了解复杂生物生态系统的单个细胞组成部分。随着相关数据的积累,利用已有标记数据间的关系,去对新数据集进行预测成为可能。一篇6月22日发表于 Nature Communications 的论文,指出图卷积神经网络能够...
10x Genomics Chromium Single Cell ATAC Solution(10X scATAC-seq)是10 X Genomics新推出单细胞表观基因组学水平上揭示染色质可接近性的研究策略。通过单细胞染色质可接近性图谱构建,不仅能清晰了解染色质结构,还可以绘制高分辨率转录因子调控网络,为深入了解疾病的诊断和治疗铺平道路。
10x单细胞ATAC测序(Singel Cell Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,scATAC-seq),该技术可进行单细胞染色质易开放区域测序,展示表观遗传学⽅⾯的变化,并深入了解基因调控机制。 染色质可及性(chromatin accessibility):DNA与组蛋白结合形成核小体,核小体进一步折叠压缩后形成染...