10x Genomics单细胞捕获技术原理 应用方案 作为10X单细胞捕获的基础型设备,Chromium controller能够应用在单细胞基因表达、免疫分析、ATAC等表观遗传学方向,详见下表。 10X Genomics 设备应用方案对比 捕获效率及重要参数 工作流程 下图以...
10x Genomics单细胞转录组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),是在单个细胞水平对 mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其能够以高通量和单分子分辨率研究单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的基因表达信号被群体的平均化所掩盖。 10x Genomics系统具有高通量、周期短、适用范围广等优势,一个样品...
测序得到的原始数据我们称之为 Raw reads,之后我们会根据 10X Genomics单细胞RNA Seq独特的文库结构,对 Reads 的 Barcode 、UMI 和插入片段部分进行拆分,之后插入片段部分将比对到参考基因组,然后统计比对到各个区域的比例,并进行表达量统计;基于表达量的结果, 进行细胞时间轨迹预测,细胞聚类等分析,基于差异表达的结果...
单细胞免疫组库测序:10X Genomics单细胞免疫组库测序是建立在GemCode技术上的微流体平台,将带有条形码和引物的凝胶珠与单个细胞包裹在油滴中;接下来在每个油滴内,凝胶珠溶解,细胞裂解释放mRNA,通过逆转录产生用于测序的带条形码的cDNA。液体油层破坏后,cDNA一分为二,后续同时进行基因表达和免疫组库文库构建;其中TCR或者...
一个系统,一套工作流程,强大的测序应用 10xGenomics公司推出了新的Chromium™系统。利用上千万独特的DNA序列标记的GEMs,Chromium™系统可揭示重要的基因组信息,进行单细胞测序分析使用。 1、全功能仪器10xChromiumController具有可伸缩的托盘和触屏界面,占用空间极小,不超过1平方英尺,却能够高效的将10万到100万次的...
10x Genomics凭借其高细胞通量、极短项目周期及极低成本脱颖而出。 技术参数 测序策略 Illumina HiSeq PE150 推荐数据量 15M 项目周期 60个自然日 技术路线 单细胞捕获 反转录扩增 建库测序 单细胞数据拆分 质控分析 基因表达定量 聚类分析 差异表达分析 ...
小果今天介绍单细胞测序平台中最受欢迎的10×genomics的原理。 单细胞测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单个细胞水平进行转录组学分析的技术。在单个细胞的分辨率下,科学家能真正的定义细胞类型…
10X Genomics BD Rhapsody 测序成本比较 Fluidigm C1：2000-3000细胞，12-100万元；10X Genomics：6000-10000细胞，2+万元；BD Rhapsody：6000-10000细胞，1.8+万元。成熟的商业化平台优势明显。测序数据质量 由于Fluidigm C1几乎只有土豪使用，因此我们主要比较后两者。从现有数据来看，很难比较两种技术的优劣，而且两种...
10x Genomics空间转录组测序 背景介绍 基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性通常可以通过对不同时间点的样本取材,再使用单细胞转录组测序技术来进行解析。然而,空间特异性信息常常难以获得。常规转录组测序和单细胞转录组测序无法还原细胞所处的原始位置信息,而传统的原位杂交技术又很难实现高通量检测。 10x ...
贝瑞基因推出单细胞水平和全长转录本兼得的转录组研究利器—10x scIso-Seq,将10x Genomics单细胞转录组测序与PacBio测序平台的全长转录组测序相结合,即利用10x Genomics单细胞平台进行数千至上万个单细胞的捕获和全长cDNA的扩增(被细胞特异性10x Barcode编码)。然后将上述cDNA分为两份,一份进行10x Genomics单细胞转录...