方法:欧易生物10× Genomics scRNA-seq 研究背景和研究目的 肺癌是最常见的癌症,每年新增170多万例。目前的组织病理学分类表明,肺癌腺癌(LUAD)占所有肺癌的大多数。虽然LUAD的治疗有了显著的改善,但不同的LUAD患者表现出不同的特征和生存率,表明LUAD的复杂性。然而,对肿瘤的发生发展具有重要作用的肿瘤微环境...
作者对3例正常宫颈,2例高阶段的上皮内病变(High-stage intraepithelial neoplasia,HSIL),4例宫颈肿瘤和1例转移性淋巴结的新鲜组织样本进行10· Genomics高通量单细胞转录组测序,绘制了宫颈癌不同阶段免疫微环境和转录调控网络,不同的免疫微环境意味着不同的免疫治疗策略。这项研究加深了人们对宫颈癌进展过程中肿瘤免疫...
技术:10×Genomics scRNA-seq单细胞转录组测序 这篇文章作者重点关注叶脉的发育调控机制,其中涉及到一些筛选叶脉发育中被激活基因的方法(方法1:通过每组10的基因,构建基因突变株进行筛选;方法2:通过研究重点关注细胞类型中的转录因子调控网络,筛选出核心的转录因子,构建基因突变株进行筛选)。 这篇文章思路首先是一个常规...
1.4.1实验原理 基于10×Genomics平台,通过快速高效的单细胞标记、测序和分析,获得单细胞水平的数字化基因表达谱,可对复杂细胞群体进行深入细致分析,绘制单细胞表达图谱。 应用:这一技术可广泛应用于癌症,免疫,干细胞,胚胎分化发育,神经分化发育等研究,为疾病或遗传发育等研究等提供了的良好机遇。 1.4.2 实验流程 获得...
To map the developmental trajectories of lung epithelial cells, we integrated and analyzed the dataset obtained in this study and the two datasets from 10× Genomics platform: Miller et al.9 (ArrayExpress: E-MTAB-8221) of 11.5 weeks, 15.0 weeks, 18.0 weeks, 21.0 weeks and Travaglini et al....
工具:Chromium Single Cell 5′ Library and Gel Bead Kit(10X Genomics);Chromium Single Cell V(D)J Reagent Kits 比对: 转录组:GRCh38; TCR/BCR data :cellranger vdj with–reference = refdata-cellranger-vdj-GRCh38-alts-ensembl-2.0.0 to assemble TCR/BCR chains and determine clonotypes ...
Also, although the cost of genome sequencing continues to decline (albeit more slowly now than in the past), the cost of single-cell genomics and the complexities of the bioinformatic analyses involved are still formidable. 对个体细胞进行分析的新技术不断涌现。目前要确定的是,nuc-seq及其它单细胞...
不同细胞与细胞之间的相互作用可以协调生物的发育，而细胞与细胞之间的相互作用是通过介质来传递信号的，...
方法:欧易生物10× Genomics单细胞转录组测序 研究背景和研究目的 角膜是一种透明的无血管组织,保护眼睛免受感染,并有助于将光线聚焦在视网膜上。角膜内皮通过屏障和泵作用调节水合作用,对维持角膜清晰度至关重要。随着年龄的增长,角膜内皮细胞(CEnCs)的逐渐丢失与Fuchs角膜内皮营养不良(FECD)的发展有关,但FECD发展...
方法:欧易生物10× Genomics scRNA-seq 研究背景和研究目的 根系是玉米生长和产量的基础。初生根由维管柱和皮层两部分组成,维管柱又由负责运输水和营养的木质部导管以及负责运输光合产物和其他有机物的初生韧皮部组成,帮助植物吸收养分。 除了玉米自身根系的解剖特点,玉米产量的增加在很大程度上与氮肥的使用有关。然而...