单细胞测序技术以单个细胞作为对象,通过对单个细胞遗传物质均匀扩增,标记建库后进行测序,最后对单个细胞基因组或转录组展开数据分析,其技术原理主要包括单细胞分离、扩增测序和数据分析3方面。 单细胞分离:主要包括荧光激活细胞分选法( flow- activated cell sorting ,FACS) 以及微流控分选法( microfluidics) 等。市场上...
将单个细胞包裹在油包水的微液滴中。基于Drop-seq的原理，10x Genomics在流动的管道中创建了一个高效的...
(3)细胞捕获效率高:单细胞捕获效率高达65%,可准确鉴别稀有细胞类型,利于稀有样本或小细胞量类型样本研究。 (4)周期短:理论上1天即可完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增及建库的所有的测序准备工作。 (5)真正意义的单细胞测序:单个GEMs捕获到多个细胞的概率极低(...
单细胞测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是在单个细胞水平进行转录组学分析的技术。在单个细胞的分辨率下,科学家能真正的定义细胞类型特定的基因表达,分辨出细胞的异质性。这是过去RNA-seq所无法企及的。 在众多的单细胞测序平台中,10×genomics最受欢迎表现最亮眼。其采用了基于微滴的微流体技术来分选细...
10×Genomics技术是由10×Genomics公司和FredHutchinson癌症研究中心开发出一种单细胞RNA测序方法,该技术可实现数千个细胞的快速高效标记、测序和分析,可以全面对接Illumina测序仪,获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况,实现细胞群体的划分与细胞群体间差异表达基因的检测。
图2.10×genomics测序原理 ◎基于微孔板的BD Rhapsody BD Rhapsody技术利用卡式芯片在磁性的寡核苷酸条形码标记微球上实现单细胞捕获和 mRNA 转录本的分子标签,然后将这些微球合并到单个管中用于 cDNA 扩增和文库构建。可满足 100~10,000 个细胞的自动分选、扩增及建库...
3.单细胞测序(10×genomics技术)的原理(数据产生) 单细胞 RNA 测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是一种在单细胞水平上利用 RNA 测序对特细胞群体进行基因表达谱定量的高通量实验技术。待测组织经过单细胞分离、RNA 提取、逆转录、文库构建和测序,便可利用数据分析(cellraner+seurat等)获得多个细胞的基因...
10x Genomics技术是一种革命性的单细胞测序方法,它可以在单细胞分辨率水平上获取基因组、转录组和表观组数据。这种技术的原理包括以下几个关键步骤: 1.单细胞悬浮液制备: 首先,将组织或细胞样本制备成单细胞悬浮液。这通常通过机械或酶处理来实现。 2.微滴封装: ...
通过UMI条形码和Microfluidics微流体技术，一次分离并标记100-10000个细胞，测序通量通常为50000reads/per cell。10XGenomics平台的高通量单细胞RNA-seq技术利用液滴法原理，结合GemCode技术，通过控制微流体的进入，将带有barcode、UMI（分子标签）、引物及酶的凝胶珠（Gelbeads）与单细胞混合，实现大规模的单...
10x Genomics单细胞转录组测序有效地解决了组织样本无法破解的细胞异质性难题,有助于发现新的细胞类型;并基于大量的单细胞基因表达数据,可以提供细胞表达特征聚类、亚群表达特征的分析、标志物筛选等方面的分析,是一种高效的单细胞基因表达水平检测技术。 02