对于连锁不平衡的计算,有很多的软件可以用,最常用的有plink和haploview,当然也有很多的R包可以进行计算。 理论上来说任意两个基因之间都可能存在连锁不平衡,但是实际操作中,认为只有一定区间范围内的基因会存在连锁不平衡,距离大于区间的基因,两者出现连锁不平衡的概率非常小,所以就不去计算。对于连锁不平衡的结果,通常...
基因连锁是一种可以导致连锁不平衡现象的机制(比如Ab在同一条染色体上距离还很近,那么它俩就会有很高...
连锁不平衡(linkage disequilibrium)是进化生物学与人类遗传学中一个十分重要的概念,因为遗传过程中很多因素能够影响它,而它又会作用于很多因素,包括选择,重组频率,突变率,遗传漂变,交配模式,群体结构等等。反过来看,连锁不平衡就是反应群体遗传过程的一个强有力的信号。 连锁不平衡是指 不同基因座(loci)的等位基因...
连锁不平衡〔linkage disequilibrium〕:是指HLA基因复合体中,分属两个或两个以上基因座位的等位基因同时出现在一条染色体上的几率高于随机出现的频率的现象。结果一 题目 名词解释连锁不平衡 答案 连锁不平衡 (lim_(x→0)_(kta)finelim) 是指基因组中不同位点上非等位基因之间在群体中的非随机组合,即出现不同基...
连锁不平衡是指分属两个或两个以上基因座位的等位基因同时出现在一条染色体上的几率,高于随机出现的频率。简单地说,只要两个基因不是完全独立地遗传,就会表现出某种程度的连锁,这种情况就叫连锁不平衡。它可以是同一条染色体上的不同区域,也可以是不同染色体上的。连锁不平衡描述了在一个群体中等位基因组合的统计学...
当r2=0,表示连锁完全平衡,随机组合同时,r2=1有更严格的解释:两个位点的等位基因有相同的频率,并且一个位点某个等位基因的出现完全预示着另外一个位点相应等位基因的出现,这时候两个位点组成的四种可能的单倍型仅表现为两种。 与D'相比,r2在连锁不平衡中更加有用,因为其具有较强的群体遗传学理论基础和一些统计学上...
基因中什么叫作连锁不平衡,什么叫连锁 答案 基因A与基因B位于同一条染色体上,在减数分裂时进入同一子细胞,通俗的说就是:“基因A与基因B总是在一起”,这种现象就称为连锁.如果在减数分裂的联会时期,同源染色体非姐妹染色单体发生了交叉互换,使得产生的子细胞中不完全是“基因A与基因B在一起”,还有“基因A与基因b...
简介:连锁不平衡以及连锁不平衡衰减 [连锁不平衡粗俗的说就是:这几个基因耍流氓,喜欢抱团遗传,不再随机。而连锁不平衡衰减是指在基因组上,随着物理距离的增大,两个连锁的的等位基因的连锁程度不断减小。] LD衰减图,在重测序类的文章中会经常出现群体遗传、GWAS等的文章里面 。
在做MR研究时,我们有一步非常重要,那就是去除存在连锁不平衡的IV。连锁不平衡主要是使用两个参数r2和kb来衡量: (1)r2:它是0~1之间的数据,r2=1表示两个SNP间是完全的连锁不平衡关系,r2=0则表示两个SNP间是完全连锁平衡的,也即这两个SNP的分配是完全随机的。
解析 在人群中,某一RFLP或者主要存在于具有某一疾病基因的染色体上;或者主要存在于正常染色体上,这种非随机的遗传现象称为连锁不平衡。结果一 题目 连锁不平衡(linkage disequilibrium) ★ 答案 连锁不平衡(linkage disequilibrium):指分属两个或两个以上的基因座位的等位基因,同时出现的几率高于或低于随机出现的几率。