RNA-Seq (RNA-sequencing) RNA-Seq也称为转录组测序，是最新发展起来的利用新一代测序技术进行转录组分析的技术，可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息，包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA，基因选择性剪接产生的不同转录本的表达丰度等。在分析转录本的结构和表达水平...
Direct RNA测序(Direct RNA Sequencing,简称DRS)是一种利用Nanopore平台进行的转录组研究技术。这项技术能够直接读取全长转录本,无需经过反转录或扩增步骤,因此可以避免这些过程中可能产生的偏差和错误。Direct RNA测序不仅能够检测RNA分子的甲基化修饰,还能解析Poly(A)特征、m5C,假尿苷等,是一种非常先进的转录组测序技...
转录组(Transcriptome)是指细胞所能转录出的所有信使 RNA(mRNA)的集合。 转录组测序(mRNA Sequencing,mRNA-Seq)是使用高通量测序技术,在给定时刻从一个基因组中,揭示 RNA 的存在和数量的一个快照的技术,为生命科学研究提供了全新的角度,可用于预测基因结构、可变剪切和其他转录修饰,并可定量测定每个转录本在生长过程...
单细胞 RNA 测序(Single cell RNA sequencing,scRNA-seq)是一种在单细胞水平上利用 RNA 测序对特细胞群体进行基因表达谱定量的高通量实验技术。待测组织经过单细胞分离、RNA 提取、逆转录、文库构建和测序,便可利用数据分析获得多个细胞的基因表达谱。 1.单细胞测序与普通转录组测序的区别 ...
3. ONT - 直接RNA测序建库流程 所用的试剂盒为Direct RNA Sequencing Kit (SQK-RNA004),首先准备 poly(A) 富集的mRNA (300ng/8ul) 或者总RNA(1ug/8ul) ,通过 poly(T) 引物反转录合成cDNA链(稳定mRNA),为RNA-cDNA加上测序接头,最后在MinION或PromethION芯片上进行测序(图11),建库总用时大约为2小时15...
RNA sequencing: 案例2:Fusion TPM3-NTRK1 fusion COSF1329 Copy number:4076.82copies/ng DNA DNAsequencing: 作者:海星生物 公众号:海星生物科技 / 苏州海星生物 以上内容由海星生物(http://www.hycyte.com)提供 我们的服务:CRISPR/Cas9细胞基因编辑、载体构建/病毒包装、分子诊断标准品/突变基因标准品/融合基因...
1. RNA-Seq: RNA-Seq是目前最常用的转录组测序技术,它能够以高通量、高灵敏度和高分辨率分析细胞中全部转录本的表达情况。RNA-Seq首先将RNA提取、逆转录为cDNA,然后通过高通量测序仪对cDNA进行测序,最后根据测序结果分析基因的表达水平和异质性剪接等信息。 2. 3'end sequencing: 3'end测序是一种用于定量研究基因...
高通量测序（High-throughput sequencing），也被称为第二代测序技术，是一种可以对DNA或RNA进行快速测序的技术。相比于传统的第一代测序技术，高通量测序能够在更短的时间内，同时测序更多的DNA或RNA样本。高通量测序的主要原理是将DNA或RNA分子随机断裂成大量小片段，并在流式细胞仪上进行高通量并行的测序。具体步骤...
在上周的文章中，我们带大家走进了单细胞测序的世界，对单细胞测序有了初步了解。今天我们将帮大家进一步熟悉单细胞转录组测序（Single Cell RNA sequencing，scRNA-seq），回顾它的发展历史，技术进程及应用案例。单细胞测序技术首次由Tang et al. 于2009年发表，用以比较单细胞测序和微芯片技术。2011年Islam et al...