2、从基因与蛋白质之间的调控关系是分子调控网络中重要的组成部分,也是转录组和蛋白组关联分析最为重要的基础之一。因此可以作为关联切入点,来挖掘具有重要调控作用的蛋白质和基因。 3、利用WGCNA分析,找出直接与表型性状具有高度相关的基因和蛋白,可以筛选掉大量的无关基因、蛋白,迅速找到重要的调控机制和关键物质。 想...
转录组研究可用于理解细胞、组织或生物体对不同刺激的响应,揭示基因调控网络,发现新基因和RNA种类,以及在疾病研究中寻找潜在的治疗靶点。 1 1 蛋白组是指一个生物体或细胞中的所有蛋白质的总体。蛋白质是由基因表达产生的,是细胞结构和功能的主要执行者。 1 蛋白组研究通常采用质谱技术,如质谱质点法(MS)和二维凝...
综上所述,本案例主要是以“转录组+DIA蛋白组”作为组学研究策略,分析思路如下所示, 1、单组学分析:差异分析、富集分析; 2、关联分析:共富集通路分析、PPI网络分析→确定关键富集通路、筛选目的基因; 3、目的基因功能研究:目的基因序列组成分析、编码蛋白结构预测;目的基因对菌株生物功能的影响。 案例中的组学分析内容...
转录组和蛋白组联合分析在生物学和医学研究中具有重要的优势,主要体现在以下几个方面: 1.全面性 转录组分析关注基因表达水平,而蛋白组分析则关注蛋白质的表达水平。联合分析可以提供更全面的生物学信息,从基因到蛋白质的全景视图,帮助研究者更好地理解细胞功能和生物过程。 2.功能验证 转录组数据可以揭示哪些基因在特...
转录组蛋白组 转录组和蛋白组是生物学研究中重要的两个层面。转录组是指一个细胞或组织中所有转录RNA(mRNA)的集合。转录组研究可以揭示基因表达的调控机制、基因功能及其与疾病的关系。而蛋白组则是指一个细胞或组织中所有蛋白质的集合。蛋白质是细胞中最重要的分子之一,不仅参与到基本代谢和细胞信号转导过程中,还...
组学(Omics),就是对某一类分子族群进行研究,包括基因组学(Genomics),蛋白质组学(Proteomics),代谢组学(Metabolomics),转录组学(transcriptomics),脂类组学(lipidomics),免疫组学(Immunomics),糖组学(glycomics ),RNA组学(RNomics)学,继续衍生还有影像组学(Radiomics),超声组学(Ultrasomics)等。
一、转录组测序与蛋白组测序的基本原理与特点 转录组测序是基于高通量测序技术，对特定生物样本中所有RNA转录本进行测序，从而获取基因表达水平、转录本结构变异等信息。这种方法具有高通量、高灵敏度和高分辨率的特点，能够全面反映生物体内转录水平的动态变化。蛋白组测序则是利用质谱技术等方法，对生物样本中的蛋白质...
转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; ...
转录组学研究基因在特定条件下的转录活性,而蛋白质组学则关注细胞或生物体内所有蛋白质的表达与功能。这两个研究领域在揭示生物体的基因调控、信号传导、代谢途径等方面发挥着重要作用。 2. 转录组学 2.1 背景 转录组学是研究细胞或生物体内所有基因在特定条件下的转录水平的科学。通过对RNA-seq技术的应用,可以获取...
背景:前人分开测过很多次肺纤维化组织的转录组,蛋白组,也一起测过,我们还是得测一次,毕竟别人有数据,数据也不是我的。我这边测一测,手里有差异分子表,也好开展后续的机制研究。 样本信息 转录组:10个组织(6个肺纤维化组织,4个正常组织)做lnc建库测序; ...