1、打开PyMOL软件,File-open-打开上面导出的pdbqt文件(图1) 2、选中大分子蛋白 点击右下角S,然后点击Selecting后面的红色文字,使其显示为Chains,然后点击中间界面中蛋白质任意位置,蛋白质表面出现较多红色点,然后点击右侧(sele)后面的A,选择rename selection。(图2) 3、将选中的蛋白名称修改为protein,或者在选中蛋白...
(小分子数据库的使用,相关程序介绍,筛选流程,结果分析与作图)拓展对接使用方法(蛋白-蛋白对接,金属酶蛋白-配体对接,蛋白-多糖对接,核酸-小分子对接,柔性对接,共价对接,蛋白水合对接,蛋白-水分子-配体对接)(Linux系统介绍使用,gromacs使用介绍,origin介绍使用,溶剂化分子动力学模拟,蛋白-配体分子动力学模拟) 更多内容...
蛋白对象的简单平移、旋转、缩放 首先将鼠标移动到2.1可视化窗口 平移,按住鼠标中键不放,然后上下左右移动,进行体会,蛋白会随着鼠标而移动 旋转,按住鼠标左键不放,然后上下左右移动鼠标,蛋白会进行旋转 缩放,按住鼠标右键不放,然后上下移动,蛋白会进行缩放 切割 滚动鼠标中键, 建议将蛋白渲染成surface模式,然后滚动鼠标...
这个工具支持零基础,零代码,基于靶蛋白的小分子、多肽、蛋白对接分析,高清结果图可在论文中直接使用。#科研者之家 #论文 #科研 #分子对接 - 科研者之家于20230824发布在抖音,已经收获了8.2万个喜欢,来抖音,记录美好生活!
蛋白质三级结构可视化1 矜持8 29212 34:48 Biogeek_Lau 02:32 【一学秒会】构建蛋白质3d结构 朱墨老师 AlphaFold2结果解读及可视化 (口齿基本清楚,故未加字幕) 面面的徐爷_Chevy 02:05 生物信息学-蛋白质三级结构预测后的模型质量评估 芒莘 08:24
百度试题 题目蛋白与小分子的相互作用是对接结果分析的关键环节,包括 相关知识点: 试题来源: 解析 氢键疏水键共价键范德华力 反馈 收藏
蛋白与小分子的相互作用是对接结果分析的关键环节,包括A.氢键B.疏水键C.共价键D.范德华力的答案是什么.用刷刷题APP,拍照搜索答疑.刷刷题(shuashuati.com)是专业的大学职业搜题找答案,刷题练习的工具.一键将文档转化为在线题库手机刷题,以提高学习效率,是学习的生产力工具
使用流程极为简单:以蛋白-小分子对接为例 ①选择蛋白:直接通过PDB数据库检索或输入PDB编号,选取目标蛋白的三维结构。 ②对接范围选择:系统自动推荐对接口袋或可选择全蛋白对接。 选择小分子:通过PubChem数据库检索或输入CID编号,挑选合适的小分子。 一键对接:设定参数后,点击开始对接,系统将自动完成分析并输出结果。
输出文件格式为xxx.dlg)可以用write complex功能与目标蛋白分子一起存成一个pdbqt文件，但Vina对接的结果...
4.2.6 实验结果与分析 书名:蛋白质结合位点预测及辅助分子对接 作者名:邱智军 本章字数:2113字 更新时间:2022-01-14 22:03:16首页 书籍详情 目录 听书 加入书架 字号 背景 手机阅读举报 后续精彩内容,上QQ阅读APP免费读上QQ阅读APP看本书,新人免费读10天账号和设备都新为新人...