对接结果分析及PyMOL可视化教程(二)#蛋白互作 第二节 对接可视化 1、打开PyMOL软件,File-open-打开上面导出的pdbqt文件(图1) 2、选中大分子蛋白点击右下角S,然后点击Selecting后面的红色文字,使其显示为 - Ai蛋白互作科研助手于20240903发布在抖音,已经收获了18个
(小分子数据库的使用,相关程序介绍,筛选流程,结果分析与作图)拓展对接使用方法(蛋白-蛋白对接,金属酶蛋白-配体对接,蛋白-多糖对接,核酸-小分子对接,柔性对接,共价对接,蛋白水合对接,蛋白-水分子-配体对接)(Linux系统介绍使用,gromacs使用介绍,origin介绍使用,溶剂化分子动力学模拟,蛋白-配体分子动力学模拟) 更多内容...
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蛋白对象的简单平移、旋转、缩放 首先将鼠标移动到2.1可视化窗口 平移,按住鼠标中键不放,然后上下左右移动,进行体会,蛋白会随着鼠标而移动 旋转,按住鼠标左键不放,然后上下左右移动鼠标,蛋白会进行旋转 缩放,按住鼠标右键不放,然后上下移动,蛋白会进行缩放 切割 滚动鼠标中键, 建议将蛋白渲染成surface模式,然后滚动鼠标...
蛋白与小分子的相互作用是对接结果分析的关键环节,包括A.氢键B.疏水键C.共价键D.范德华力
①选择蛋白:直接通过PDB数据库检索或输入PDB编号,选取目标蛋白的三维结构。 ②对接范围选择:系统自动推荐对接口袋或可选择全蛋白对接。 选择小分子:通过PubChem数据库检索或输入CID编号,挑选合适的小分子。 一键对接:设定参数后,点击开始对接,系统将自动完成分析并输出结果。
科研者之家的分子对接工具支持零基础,零代码,基于靶蛋白的小分子、多肽、蛋白对接分析,高清结果图可在论文中直接使用。#科研者之家 #论文 #科研 #分子对接 - 科研者之家于20240722发布在抖音,已经收获了8.2万个喜欢,来抖音,记录美好生活!
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结论在最后一段,中间分析没兴趣看可以跳过。简单讲下其中最具有误导性的几个结论,首先【结果显示,虽然SARS和2019ncov的S基因十分不同,但最后形成的S蛋白,折迭构型却几乎相同。】虽然因为氨基酸序列接近,所以结论很可能是差不多正确的,但是这篇文章里能做出折叠构型几乎相同的根本原因不是因为序列相似,而是因为他们...