本文首先提出了一种结合对比学习和预训练语言模型的方法(CLAPE),以此来预测DNA结合位点。为了评估模型的分类性能和泛化能力,作者在两个外部蛋白质与DNA结合位点的测试集进行了实验,结果表明在仅基于序列信息的条件下CLAPE-DB具有更优的泛化能力,并对于DNA结合位点具有特异性。因此该模型的提出有助于人们探索未知结构...
DNA足迹法常用来检测蛋白质在DNA上的结合位点,其原理如图所示。先将待测DNA一条链的一端用放射性同位素标记,加入 DNA 结合蛋白后,再用核酸内切酶DNase I 随机切割待测 DNA,被蛋白质结合的区域可免于切割。最后将酶切后的DNA 片段变性后电泳,放射性同位素标记的DNA经处理后会显示出条带。下列说法错误的是( ) A...
表1. ULDNA和9种蛋白质-DNA结合位点预测方法在PDNA-128测试集上的性能比较 进一步,研究人员分别单独或联合利用蛋白质大语言模型ESM2、ProtTrans和ESM-MSA transformer抽取序列的特征表示,再结合LSTM-Attention Network进行DNA结合位点预测,进...
百度试题 结果1 题目( )是DNA上的蛋白质结合位点,可以阻止转录。操纵基因阻遏蛋白启动子诱导物 相关知识点: 试题来源: 解析 A 反馈 收藏
转录因子结合位点(TFBS)是TF结合的DNA片段,通常在4-30bp范围内。转录因子通常同时调节多个基因,在某种程度上,其在不同基因上的结合位点是保守的,但并不完全相同。因此,DNA-蛋白质结合的准确预测对于理解转录因子的生理作用,表征基因组的特定功能特征以及阐明在复杂生物体中如何精心编排高度特异性的序列表达程序...
测定蛋白质与DNA结合位点的电泳迁移率变动分析法(1)放射性标记DNA探针的制备l聚丙烯酰胺凝胶的制备1.按照(三)中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决
1.一种检测蛋白质DNA结合位点的方法,其特征在于,包括: 将DNA片段库进行测序,以便获得DNA片段库的DNA序列,所述DNA片段库的DNA片段在测序接头互补位后的序列是随机的,所述DNA片段库中的DNA片段预先与所述测序接头互补配对结合; 去除测序后的DNA片段库中的新生链; 以DNA片段库的DNA片段为模板,将所述测序接头与所述...
DNA-蛋白质结合位点DNA形状特征密集连接网络容错编码多尺度卷积能够与基因上游的特定核苷酸序列结合的蛋白质被称为转录因子,转录因子结合位点是指与特定的转录因子结合的DNA片段,它被称为基序,通常位于基因的上游区域.准确预测DNA-蛋白质结合位点(DNA-protein binding sites,DPBS)对于研究基因表达的调控机制具有重要的生物...
本发明提出了检测蛋白质DNA结合位点的 方法。包括:将DNA片段库进行测序;去除测序 后的DNA片段库中的新生链;以DNA片段库的 DNA片段为模板,将不带有荧光标记的dNTP依次 聚合在测序接头的3’端,将带有荧光标记的 dNTP聚合在聚合产物3’端的最后一位;记录聚 ...
( )是DNA上的蛋白质结合位点,可以阻止转录。 A.诱导物 B.阻遏蛋白 C.启动子 D.操纵基因 点击查看答案手机看题 你可能感兴趣的试题 判断题 两个同源的基因,外显子间的相似性一般要高于内含子。( ) 答案:错误 手机看题 单项选择题 可变剪接能增加转录产物,这些转录产物间的区别在于( )。 A.mRNA的5’非转...