转录因子结合位点(TFBS)是TF结合的DNA片段,通常在4-30bp范围内。转录因子通常同时调节多个基因,在某种程度上,其在不同基因上的结合位点是保守的,但并不完全相同。因此,DNA-蛋白质结合的准确预测对于理解转录因子的生理作用,表征基因组的特定功能特征以及阐明在复杂生物体中如何精心编排高度特异性的序列表达程序...
目前国内外对于DNA-蛋白质绑定位点预测的研究大多集中在仅以蛋白质序列信息或仅以蛋白质结构信息为基础进行计算,而二者结合所实现的预测效果较差.本文提出一种在蛋白质位置特异性得分矩阵序列特征的基础上,结合蛋白质残基的溶剂可及表面积、相对表面积、深度和突出指数这几个结合效果良好的结构特征的DNA与蛋白质绑定...