1.R语言分布式滞后非线性模型(DLNM)空气污染研究温度对死亡率影响建模 2.R语言分布滞后线性和非线性模型(DLNM)分析空气污染(臭氧)、温度对死亡率时间序列数据 3.R语言群组变量选择、组惩罚GROUP LASSO套索模型预测分析新生儿出生体重风险因素数据和交叉验证、可视化 4.R语言逻辑回归、随机森林、SVM支持向量机预测FRAMINGHA...
单位:Computational Mass Spectrometry @ Pacific Northwest National Laboratory 可以看到前面的3章是蛋白质组代谢组数据分析独特的步骤,仍然是为了输出表达量矩阵。五年前我们也有一个蛋白质组学数据处理的实战系列教程,前面我们分享的是: 蛋白质组学第1期-认识基础概念 蛋白质组学第2期-认识蛋白质组学原始数据 蛋白质...
蛋白质组学数据分析流程 蛋白质组学集成化R包Promor使用,先无脑跑一遍示例,看看效果哈。 1.构建对象,需要两个表格。一个是蛋白组的表达矩阵,另一个是样本信息表。 library(promor)raw_2<-create_df(prot_groups="https://raw.githubusercontent.com/caranathunge/promor_example_data/main/st.txt",exp_des...
首先是用目的蛋白÷内参蛋白(actin),我定义为x_r wb$A_r<-wb$A/wb$Actin wb$B_r<-wb$B/wb$Actin wb$C_r<-wb$C/wb$Actin 用x_r除以NC组的相对比,我将他定义为'x_n'.由于没有excel的$E$2这种实现固定的办法,因此我想办法曲折了一下,我的思路是先新增一列A_n,然后前3行除以A_r的第一行...
R在RNAseq和基因组关注的比较多,在蛋白质组研究中虽然用的多,但是专门的博客和文章比较少,转载一个蛋白质组学数据分析的文章。 原文见https://datascienceplus.com/proteomics-data-analysis-1-3-data-acquisition-and-cleaning/ Proteomics Data Analysis (1/3): Data Acquisition and Cleaning ...
DEP2是用于定量蛋白质组学数据下游处理、差异分析、可视化的工具R包。DEP2利用S4对象进行数据打包并通过limma进行差异分析。DEP2集成肽段至蛋白重定量算法、缺失值填充方法,可用于分析肽段层面和蛋白组层面的定量蛋白质组、修饰蛋白质组数据。同时,...
R-mediated phagocytosis 9 0.35 0.012 1.92 Leukocyte transendothelial migration 8 0.3 0.013 1.89 Intestinal immune network for IgA production 7 0.25 0.014 1.85 Chemokine signaling pathway 6 0.2 0.015 1.82 GO 分析 /cgi-bin/wego/index.pl 蛋白列表1的GO 蛋白列表2的GO GO的汇总统计表 GO 分析 GO的...
基于R语言和Maxquant分析结果的蛋白质组学数据处理及数据整合软件是由谱度众合(武汉)生命科技有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2022SR1517249,属于分类,想要查询更多关于基于R语言和Maxquant分析结果的蛋白质组学数据处理及数据整合软件著作的著作权信息就到
5.Sokal, R. R.; Rohlf, F. J., Biometry: the principles and practice of statistics in biological research. 3rd ed. New York: W. H. Freeman and Company, 1995. 北京博奥麦斯生物技术有限公司,简称“博奥麦斯”,专注于开拓前沿蛋白质组和代谢组学技术,秉承“科学公正、高效准确、求实创新、卓越和谐...
粘贴蛋白序列：PGYRNNVVNTMRLWSAKAPNDFNLKDFNVG 选择“Onlythefollowingselectionofenzymesandchemicals”，并选择胰酶Trypsin酶切 蛋白质组学质谱分析背景介绍APNDFNLK 蛋白质组学质谱分析背景介绍 vAlanine 1lettercode A Arginine R AsparagineN AsparticacidD AsnorAsp B Cysteine C GlutamicacidE Glutamine Q ...