STRING数据库是用于分析蛋白互作分析(Protein-Protein Interaction, PPI)的专业数据库平台,它收录了超过14000个物种、6千多万种蛋白、200多亿个相互作用的信息,涵盖范围极其广泛。 科研人员可以借助STRING数据库查找疾病相关蛋白之间的相互作用,分析其潜在的功能关联,进而揭示疾病背后复杂的分子调控网络;在药物研发方面,通过...
STRING(Search Tool for the Retrieval of Interaction Gene/Proteins)数据库是目前使用最广泛、信息最全面的蛋白互作网络分析工具,既包含了已有报道的蛋白质互作数据,也包含了基于预测的蛋白质互作信息。文章中一般以PPI(Protein‑Protein Interaction)互作网络图进行展示,每个节点为一个差异蛋白,节点之间的连线表示两个...
指明本报告所涉及的数据范围和限制 02 CATALOGUE 蛋白组学数据概述 数据来源 组织样本 从人体或动物体的不同组织中提取蛋白质进行蛋白组学分析。细胞样本 通过培养细胞或直接从生物体中提取细胞进行蛋白组学分析。生物体液 如血液、尿液、脑脊液等，含有丰富的蛋白质信息，可用于蛋白组学分析。数据类型 01 蛋白质鉴定数据...
复现PCA原图之蛋白组学数据 NGS系列文章包括 NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:… 生信宝典 ...发表于生信宝典 Cell上的经典蛋白组学、磷酸化蛋白组学、WES多组学联合分析文献 鹿明生物 蛋白质组学研究方法概述...
蛋白质组数据分析软件---Perseus swate01 1.7万 5 蛋白质组学常规分析,含实例演示 生科驿站 4595 1 【20220813】【蛋白质组学常见研究思路】 一块基因砖 1.0万 0 蛋白质组学数据怎么处理?MaxQuant搜库前的准备工作 谱度众合 1925 0 蛋白组学报告文件解读 谱天之下_327 1899 0 质谱鉴定蛋白质的数据...
本报告所分析的蛋白组学数据来源于公共数据库或实验室内部研究。 分析内容 报告将涵盖蛋白质鉴定、定量、差异表达分析、蛋白质相互作用预测、功能注释及通路 分析等关键分析步骤。 结果展示 报告将以图表、表格和文字描述等形式展示分析结果,包括蛋白质表达谱、差异表达蛋 白质列表、蛋白质相互作用网络、功能注释结果和通...
蛋白组学数据分析是研究蛋白质功能、相互作用及表达的关键过程。对于刚入行的小白来说,以下是完成蛋白质组学数据分析的基本流程。 蛋白质组学数据分析流程 每一步具体操作 1. 数据采集 在这个步骤中,我们需要从实验获得初步数据。通常,这些数据会被存储为CSV或文本文件。例如,protein_data.csv。
6.进行分类或聚类分析,识别不同样本之间的蛋白质表达模式。 Conduct classification or clustering analysis to identify protein expression patterns among different samples. 7.进行通路富集分析,挖掘蛋白质在生物学通路中的功能和相互作用。 Perform pathway enrichment analysis to explore the functions and interactions...
蛋白质相互作用研究蛋白组学分析的方法和技术对原始数据进行清洗、标准化和归一化,以提高分析的准确性和可靠性。数据处理差异表达分析通路和功能分析可视化比较不同条件或状态下蛋白质的表达差异,找出关键的差异表达蛋白质。对差异表达蛋白质进行通路和功能注释,深入理解其在生物学过程和疾病中的作用。利用生物信息学工具...
随着基因组计划的完成,生命科学领域已经进入以“组学”为研究标志的后基因组时代(post-genomic era)。蛋白质组学(Proteomics)的概念源于蛋白质(protein)与基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组数据(proteome database)包含...