综上所述,在进行转录组与蛋白组关联的时候,主要可以从三个方面来展开分析: 1、在已有目标通路的前提下,整合与通路相关的基因表达量、蛋白质含量信息来绘制一个具有物质动态变化的通路图,可以直观地查看通路整体的变化情况,挖掘重要的调控物质。 2、从基因与蛋白质之间的调控关系是分子调控网络中重要的组成部分,也是...
在临床上已经报道大黄素通过改善肺部炎性微环境以减轻SAP和SAP-ALI。在这项研究中,通过建立了SAP-ALI大鼠模型,运用蛋白组学+转录组学研究评估了大黄素治疗后肺部炎症、血浆外泌体内容物以及巨噬细胞表型变化。在体外和体内评估了大黄素干预后的SAP大鼠血浆外泌体对肺泡巨噬细胞表型的影响。本文探索SAP-ALI发展的潜在...
🔍Omicsmart平台的mRNA-Protein关联平台,可以帮助您整合转录组和蛋白质组数据,发现功能基因和蛋白质水平上的一致性表达,从而更全面地解析生物学机制。 文章总结 在这项研究中,作者巧妙地结合了转录组和蛋白组技术,深入探究了绿藻代谢产物(EME)如何影响LNR1的生理响应和分子机制。转录组分析揭示了EME对假单胞菌LNR1...
转录组研究可用于理解细胞、组织或生物体对不同刺激的响应,揭示基因调控网络,发现新基因和RNA种类,以及在疾病研究中寻找潜在的治疗靶点。 1 1 蛋白组是指一个生物体或细胞中的所有蛋白质的总体。蛋白质是由基因表达产生的,是细胞结构和功能的主要执行者。 1 蛋白组研究通常采用质谱技术,如质谱质点法(MS)和二维凝...
基因与蛋白之间,从来都不是“单向奔赴”的,它们互相影响互相作用,从而才能产生特定的生物功能。想要深入挖掘其中错综复杂的分子关系,就需要将转录组学与蛋白组学结合起来分析。转录组与蛋白组相结合,上可研究基因的起始表达对蛋白形成的影响,下可挖掘基因表达产物对基因表达的反调控作用。
转录组学和蛋白组学联合分析 转录组学和蛋白组学都是获得基因的表达情况的重要工具,从生物学角度上看,转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;而蛋白是生物体直接的功能执行者,因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势。要全面探究生物体疾病机理、胁迫机制,精确研究重要基因的表达模...
在时间序列实验中,转录组和蛋白组的联合分析可以揭示基因表达和蛋白质积累的动态变化,帮助理解生物过程的时序机制。 4.疾病机制研究 在疾病研究中,转录组和蛋白组的联合分析可以为疾病的发生机制提供更为全面的证据,揭示潜在的生物标志物或治疗靶点,推动个性化医学的发展。
转录组+蛋白组的联合分析的从差异基因和差异蛋白入手进行关联分析,使用KEGG的注释信息来对转录组和蛋白组进行关联,注释到同一个KEGG Functional ortholog编号(K 开头的编号)的基因和蛋白被记为一对有关联的基因和蛋白。如果使用转录组数据建库,得到的蛋白ID与转录本ID格式相同,通过人为指定的方式将基因和蛋白一一对应起...
(1)两组学的联合分析可以获得基因的转录组与蛋白组学表达水平,实现两者的互补,对特定状态下生物体中mRNA和蛋白质表达水平进行全方位分析。 (2)将转录组和蛋白组联合分析可以获得对差异表达的深层分析,挖掘受转录后调控的差异基因或差异蛋白,寻找并验证某些重要的调控通路。
转录组和基因组水平不同,转录组是高度动态的,当细胞受到侵犯时,甚至当细 胞处于正常的生理活动如复制,分裂时,基因的转录情况也会变化很大,产生不同的转 录组。mRNA是信使RNA,携带着从基因组转录下来的遗传信息,但并不是所有的基因 都同时转录,是受转录因子控制的,而且并非所有基因组序列都能转录。原核生物中非 ...