Autodock分子对接--1. 准备工作(用pymol查看三维结构,去除水分子,分离蛋白和小分子) Autodock分子对接--2.蛋白和小分子的预处理(导出PDBQT) Autodock分子对接--完结撒花! 先看一下蛋白质相互作用关系数据库(如果无法打开属于网络问题,不要问我): 1.DIP 实验方法测定的蛋白质之间的相互作用。 2.BioGRID 主要...
Autodock分子对接--1. 准备工作(用pymol查看三维结构,去除水分子,分离蛋白和小分子) Autodock分子对接--2.蛋白和小分子的预处理(导出PDBQT) Autodock分子对接--完结撒花! 先看一下蛋白质相互作用关系数据库(如果无法打开属于网络问题,不要问我): 1.DIP 实验方法测定的蛋白质之间的相互作用。 2.BioGRID 主要...
分子对接(molecular docking)是分子模拟的重要方法之一,其本质是两个或者多个分子之间的识别过程,早期的分子对接方法使用分子力学方法或者量子化学方法计算小分子之间分子识别,然而由于算法和计算机处理能力的限制,较难处理含有大分子的分子对接过程。随着计算机算力的大幅提升,几何匹配计算通常采用格点计算,片段生长等方法,能量...
用Autodock做分子对接需要先准备蛋白和小分子的3的结构文件,并且生成Autodock接受的pdbqt格式。这个视频介绍了不同情况下如何用AutoDockTools生成pdbqt文件,还有怎么用openbabel转换结构文件的格式。 知识 野生技能协会 生物 野生技术协会 科研 生物信息 分子对接 ...
利用分子对接技术研究蛋白质与多酚间的相互作用,并同光谱实验的结论进行分析、比较从而互相验证、补充,进而能够从实验和理论研究其相互作用。目前,关于原儿茶醛(PCA)和阿魏酸(FA)与大分子相互作用的机理研究较少,并且在食品领域的应用范围也较小,为使其在食品加工、贮藏保鲜等多个领域中像没食子酸酯(EGCG)、茶多酚...
利用分子对接技术研究蛋白质与多酚间的相互作用,并同光谱实验的结论进行分析、比较从而互相验证、补充,进而能够从实验和理论研究其相互作用。目前,关于原儿茶醛(PCA)和阿魏酸(FA)与大分子相互作用的机理研究较少,并且在食品领域的应用范围也...
分子对接采用光谱法和分子对接技术分别研究原儿茶醛(protocatechuic aldehyde,PCA)和阿魏酸(ferulic acid,FA)与牛血清白蛋白(bovineserumalbumin,BSA)的相互作用,同时比较PCA和FA分别与BSA的结合能力,从而揭示其相互作用机理,为其在食品领域的广泛应用提供实验依据.结果表明:PCA和FA主要靠氢键和范德华力与BSA形成稳定的...
Autodock分子对接--1. 准备工作(用pymol查看三维结构,去除水分子,分离蛋白和小分子) Autodock分子对接--2.蛋白和小分子的预处理(导出PDBQT) Autodock分子对接--完结撒花! 先看一下蛋白质相互作用关系数据库(如果无法打开属于网络问题,不要问我): 1.DIP ...
用Autodock做分子对接需要先准备蛋白和小分子的3的结构文件,并且生成Autodock接受的pdbqt格式。这个视频介绍了不同情况下如何用AutoDockTools生成pdbqt文件,还有怎么用openbabel转换结构文件的格式。 知识 野生技能协会 生物 野生技术协会 科研 生物信息 分子对接 ...
Autodock分子对接--1. 准备工作(用pymol查看三维结构,去除水分子,分离蛋白和小分子) Autodock分子对接--2.蛋白和小分子的预处理(导出PDBQT) Autodock分子对接--完结撒花! 先看一下蛋白质相互作用关系数据库(如果无法打开属于网络问题,不要问我): 1.DIP 实验方法测定的蛋白质之间的相互作用。 2.BioGRID 主要...