用Autodock做分子对接需要先准备蛋白和小分子的3的结构文件,并且生成Autodock接受的pdbqt格式。这个视频介绍了不同情况下如何用AutoDockTools生成pdbqt文件,还有怎么用openbabel转换结构文件的格式。 知识 野生技能协会 生物 野生技术协会 科研 生物信息 分子对接 ...
1.残基电荷要为整数，说明电荷没加对. 2 如果是2个亚基含有2个相同位点，可以删一个.[ 发自小木虫...
CADD药物设计,分..“计算机辅助药物设计技术与应用”线上专题培训班大纲课程名称 课程内容 生物分子互作基础 1.生物分子互作用研究方法1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理1.2 分子对接研究生物分子相互作用1.3
autodock适合蛋白与小分子对接，不适合蛋白蛋白，可以选用HEX，ZDOCK，Rosetta 发自小木虫Android客户端 ...
并先后与2个铁氧化还原蛋白形成电子传递复合体,当铁氧化还原蛋白还原酶将电子传递给铁氧化还原蛋白的[Fe-S]中心后,铁氧化还原蛋白发生构像变化,与铁氧化还原蛋白还原酶分离,转而与末端氧化酶发生作用,将电子传递到末端氧化酶的[Fe-S]中心,最后电子经过单核铁催化中心,在末端氧化酶的作用下,消耗一个氧分子,实现...
对七个氨基酸进行改造,增大 NDO 的活性口袋,能增强酶对高环 PAHs 的结合能力, 为 NDO 的分子改造提供参考。。 关键词:萘双加氧酶;同源建模;分子对接;活性中心;蛋白设计 Molecular simulation of the interaction of naphthalene dioxygenase and polycylic aromatic hydrocarbons Abstract Polycyclic aromatic hydrocarbons...
蛋白质及仿生酶对手性荧光探针分子的分子识别 热度: 蛋白质3D建模-酶与底物分子模拟对接-autodock 文档信息 主题:关于“高等教育”中“生物学”的参考范文。 属性:Doc-94XVNV,doc格式,正文30960字。质优实惠,欢迎下载! 适用: 作为内容写作的参考文案,解决如何写作、正确编写文案格式、内容摘取等相关 ...
在pdbqt文件中找到Fe原子，并在后面手动修改原子电荷即可
关键词:萘双加氧酶;同源建模;分子对接;活性中心;蛋白设计 MolecularsimulationoftheinteractionofnaphthalenedioxygenaseandpolycylicaromatichydrocarbonsAbstractPolycyclicaromatichydrocarbons(PAHs)areaclassoftypicalaromatichydrocarbonsorganicpollutantswhichinclude16commoncongeners.Inrecentyears,pollutionduetoPAHshasarousedgreat...
并先后与2个铁氧化还原蛋白形成电子传递复合体,当铁氧化还原蛋白还原酶将电子传递给铁氧化还原蛋白的[Fe-S]中心后,铁氧化还原蛋白发生构像变化,与铁氧化还原蛋白还原酶分离,转而与末端氧化酶发生作用,将电子传递到末端氧化酶的[Fe-S]中心,最后电子经过单核铁催化中心,在末端氧化酶的作用下,消耗一个氧分子,实现...