一、蛋白质与药物相互作用的重要性 蛋白质与药物的相互作用具有重要的临床意义。通过作用于特定的蛋白质,药物可以调节细胞功能、干扰病理过程并治疗疾病。例如,抗生素可以抑制细菌蛋白质的生物合成,从而杀死细菌;激素可以与靶细胞的受体结合,调节细胞生理过程。 此外,了解蛋白质与药物的相互作用有助于药物的研发与设计。
为了弥补现有深度学习方法在预测蛋白化合物相互作用过程中多类特征间不平衡的现象,作者提出了一种基于变量期望最大化的多尺度表示学习方法 MUSE,它有效地融合原子结构特征和分子网络之间的多尺度信息进行学习蛋白与化合物间相互作用的模式。它通过相互监督和迭代优化来融合原子结构和分子网络尺度之间的多尺度信息。该方法通...
一、药物与蛋白质的相互作用机制 药物能够起到治疗疾病的效果,是因为药物与蛋白质具有一定的相互作用。在人体内,药物与蛋白质之间的相互作用主要有以下几种形式: 1.氢键相互作用:药物与蛋白质上的极性官能团之间可以通过氢键形成纠缠作用。氢键是指通过一个氢原子连接的两个分子之间的作用。药物分子所含有的氧原子、氮...
例如靶向PPI的小分子药物navitoclax,能进入细胞与抗凋亡蛋白BCL-2紧密结合,阻断BCL-2与促凋亡蛋白BAK/BAX的相互作用,从而促进凋亡。小分子用于PPI互作的调控虽对靶标定位比较普适,但也有其缺陷。由于PPI互作的界面表面积往往较大(约1000-3000Å^2),且PPI的作用界面较为平坦,使得小分子和蛋白难以结合,亲和力较低,...
蛋白质是由氨基酸组成的,它们可以通过共价键和非共价键与其他分子相互作用。药物通常是小分子有机化合物或生物大分子。在药物分子与蛋白质分子相互作用的过程中,药物分子会与蛋白质中的氨基酸残基发生相互作用。 药物与蛋白质相互作用的主要方式包括静电相互作用、范德华相互作用和氢键相互作用。静电相互作用通常发生在药...
一、蛋白质与药物相互作用的研究方法 1. X射线晶体学 X射线晶体学是一种常用的研究蛋白质与药物相互作用的方法。通过将蛋白质与药物进行结晶,利用X射线将结晶体进行照射,可以得到蛋白质与药物的高分辨率结构。这种方法可以帮助我们了解药物与蛋白质之间的空间结构以及相互作用的具体机制,为药物的设计和优化提供重要信息...
蛋白-配体相互作用指纹(protein-ligand interaction fingerprint, IFP)就是其中一种常见的数值化方式,这种方法利用二进制编码的思路来记录蛋白-药物之间不同类型的相互作用,在这里我们系统回顾一下IFP的系列方法以及应用案例。 1. IFP方法概述 IFP方法最早由Deng...
药物与蛋白质之间的相互作用对于药物的效力有着至关重要的影响。药物可以与蛋白质的表面成分相互配对,从而影响其生物学效应。与此同时,一些药物也会影响蛋白质的构象,从而影响蛋白质的功能。 基于这些原因,研究药物与蛋白质之间的相互作用已成为现代药理学中非常重要的领域。在这个领域,科学家们使用基于计算机的技术来预...
蛋白质药物相互作用米粒蛋白纳米 药物进入血浆后游离型药物结合型药物未被蛋白结合可透过生物膜产生效应或进行代谢、排泄与血浆蛋白结合体积增加不易透过血管壁,暂时失去药理活性.药物与蛋白质结合部位:阴离子:阴离子:与氨基酸的N+结合与氨基酸的N+结合阳离子:阳离子:与氨基酸的COO-结合与氨基酸的COO-结合非离子:非离子...
蛋白质与药物的相互作用是药物研发过程中的关键环节之一。药物的靶点通常是蛋白质,药物通过与蛋白质结合从而发挥其药理作用。因此,准确地分析和预测蛋白质与药物的相互作用对于药物的研发和临床应用至关重要。 二、蛋白质与药物相互作用的研究方法 1. 结构生物学方法 结构生物学方法主要包括X射线晶体学、核磁共振和电子...