一、蛋白质与药物相互作用的重要性 蛋白质与药物的相互作用具有重要的临床意义。通过作用于特定的蛋白质,药物可以调节细胞功能、干扰病理过程并治疗疾病。例如,抗生素可以抑制细菌蛋白质的生物合成,从而杀死细菌;激素可以与靶细胞的受体结合,调节细胞生理过程。 此外,了解蛋白质与药物的相互作用有助于药物的研发与设计。
一、药物与蛋白质的相互作用机制 药物能够起到治疗疾病的效果,是因为药物与蛋白质具有一定的相互作用。在人体内,药物与蛋白质之间的相互作用主要有以下几种形式: 1.氢键相互作用:药物与蛋白质上的极性官能团之间可以通过氢键形成纠缠作用。氢键是指通过一个氢原子连接的两个分子之间的作用。药物分子所含有的氧原子、氮...
药物与蛋白质的相互作用决定了药物效应，包括药代动力学和药效学，如生物利用度、代谢、疗效和不良反应。此外，药物与蛋白质的相互作用在毒性和免疫反应中也起着重要作用。为了研究小分子药物与蛋白质的相互作用，人们开发了多种工具，包括基于（光）亲和力和基于活性的方法，这些方法可以对药物与蛋白质相互作用组进行无...
寡核苷酸(ON)类药物的蛋白质相互作用组的方法目前研究较少。通常采用的是体外检测法,即把寡核苷酸药物固定在珠子上并与细胞裂解液孵育,然后用竞争性寡核苷酸药物洗脱蛋白结合体。这种检测方法已成功用于鉴定目前已知的约 80 种反义寡核苷酸(ASO)结合体中的大部分,并构成了现在有关 ON 药物与蛋白质相互作用以及它们...
蛋白质是由氨基酸组成的,它们可以通过共价键和非共价键与其他分子相互作用。药物通常是小分子有机化合物或生物大分子。在药物分子与蛋白质分子相互作用的过程中,药物分子会与蛋白质中的氨基酸残基发生相互作用。 药物与蛋白质相互作用的主要方式包括静电相互作用、范德华相互作用和氢键相互作用。静电相互作用通常发生在药...
#.药物-蛋白质相互作用定义药物-蛋白质相互作用定义:1.药物-蛋白质相互作用(drug-proteininteraction,DPI)是指药物与蛋白质之间的相互作用。2.DPI可以发生在药物与靶蛋白、载体蛋白、代谢酶和转运蛋白等多种类型的蛋白质之间。3.DPI可以影响药物的吸收、分布、代谢、排泄和药效,从而影响药物的安全性与有效性。药物-...
鉴定新的药物-蛋白质相互作用对于药物发现至关重要,基于机器学习的方法利用药物描述符和一维(1D)蛋白质序列已经开发了许多鉴定方法。这些方法一般都是通过将配体,蛋白质及其相互作用的信息整合到一个统一的框架中,将是否存在相互作用的预测作为二元分类的任务。
导读:蛋白质相互作用(PPIs)是许多生物过程的基础,在各种疾病的发生和发展中起着重要作用。靶向肿瘤相关蛋白与新兴小分子药物之间的相互作用已成为治疗人类疾病,尤其是肿瘤的一种有吸引力的方法。令人鼓舞的是,基于PPI的选择性治疗药物在过去十年中迅速发展,为癌症患者的新疗法提供了有希望的前景。
一、蛋白质与药物相互作用的研究方法 1. X射线晶体学 X射线晶体学是一种常用的研究蛋白质与药物相互作用的方法。通过将蛋白质与药物进行结晶,利用X射线将结晶体进行照射,可以得到蛋白质与药物的高分辨率结构。这种方法可以帮助我们了解药物与蛋白质之间的空间结构以及相互作用的具体机制,为药物的设计和优化提供重要信息...
MUSE 是一种多尺度学习方法,通过变分期望最大化(EM)框架,将分子结构建模和蛋白质与药物相互作用网络学习相结合。EM 框架在多次迭代的交替过程中优化两个模块,即期望步骤(E-step)和最大化步骤(M-step)。 在E-step 期间,MUSE 利用每个生物分子的结构信息来学习有效的结构表示,以便在 M-step 中使用已知的相互作用...