在经过一系列的算法的操作之后,作者获得了肠道各个样本的微生物菌群。因此也就对这些数据进行了简单的分析。首先作者使用SparCC算法来对肠道肿瘤CRC(COAD/READ)进行了聚类分析。最后发现CRC总共可以分成梭菌和拟杆菌两个聚类种群。 进一步基于两个聚类的分型,来分析不同的菌群对于其他组学RNA-seq、miRNA-seq、甲基化、RP...
3. 公开课回顾 | 如何用代谢组学做好我的临床研究 4. 公开课回顾 | 血清游离脂肪酸在个体发生代谢异常的重要作用 5. 公开课回顾 | 胆汁酸全谱分析在临床应用中的探索与案例分析 6. 公开课回顾 | 肠道菌群和宿主代谢组学相关性研究的分析策略 7. 公开课回顾 | 多组分药物Poly-PK研究策略 8. 公开课回顾 ...
当生物学功能比较明确时,可以此为发现集数据进一步选择其他中心临床大样本集、相关疾病模型的动物水平样本、细胞水平样本等开展多水平的验证性试验,当显著的差异代谢物在临床大样本集得到确认后可进行ROC等分析进一步筛选潜在
在经过一系列的算法的操作之后,作者获得了肠道各个样本的微生物菌群。因此也就对这些数据进行了简单的分析。首先作者使用SparCC算法来对肠道肿瘤CRC(COAD/READ)进行了聚类分析。最后发现CRC总共可以分成梭菌和拟杆菌两个聚类种群。 进一步基于两个聚类的分型,来分析不同的菌群对于其他组学RNA-seq、miRNA-seq、甲基化、RP...
因此也就对这些数据进行了简单的分析。首先作者使用SparCC算法来对肠道肿瘤CRC(COAD/READ)进行了聚类分析。最后发现CRC总共可以分成梭菌和拟杆菌两个聚类种群。 进一步基于两个聚类的分型,来分析不同的菌群对于其他组学RNA-seq、miRNA-seq、甲基化、RPPA的影响。寻找这些菌群可能的作用机制。 差异菌群分析以及预后相关...