以下是16S测序分析流程的解读: 1.样品采集:首先,需要采集肠道样本,通常是通过粪便样本来获取肠道菌群。 2. DNA提取:将从样本中提取的总DNA,这是后续测序分析的起始材料。 3. PCR扩增:使用特定的引物对16S rRNA基因的V3-V4区进行PCR扩增。这个区域包含了用于物种分类的足够的信息。 4.测序:将扩增后的DNA进行测序...
16S分析流程 16S分析流程主要包括:Hiseq/Miseq测序获得的Paired-end (PE) reads拼接成一条序列,对目标序列进行质控过滤,过滤后的序列与参考数据库作比对,去除嵌合体序列得到最终得优化序列。基于优化序列进行OTU聚类分析和物种分类注释,基于OTU聚类结果进行多样性指数分析,基于分类学信息进行物种结构分析和物种差异分析。
宏基因组测序实验流程 从环境(如土壤、海洋、淡水、肠道等)中采集实验样本,将原始采样样本或已提取的 DNA 样本低温运输(0℃以下),对样品进行样品检测。检测合格的 DNA 样品,进行文库构建以及文库检测,检测合格的文库将采用 Illumina 高通量测序平台进行测序,测序得到的下机数据(Raw Data)将用于后期信息分析。 为保证...
以下是16S测序分析流程的解读: 1.样品采集:首先,需要采集肠道样本,通常是通过粪便样本来获取肠道菌群。 2. DNA提取:将从样本中提取的总DNA,这是后续测序分析的起始材料。 3. PCR扩增:使用特定的引物对16S rRNA基因的V3-V4区进行PCR扩增。这个区域包含了用于物种分类的足够的信息。 4.测序:将扩增后的DNA进行测序...
16S分析流程 16S分析流程主要包括:Hiseq/Miseq测序获得的Paired-end (PE) reads拼接成一条序列,对目标序列进行质控过滤,过滤后的序列与参考数据库作比对,去除嵌合体序列得到最终得优化序列。基于优化序列进行OTU聚类分析和物种分类注释,基于OTU聚类结果进行多样性指数分析,基于分类学信息进行物种结构分析和物种差异分析。