今天小编继续跟大家分享一个最近比较热门的基因集—线粒体自噬相关基因集 线粒体自噬(mitophagy)是真核细胞通过自噬机制选择性清除功能失调或者多余线粒体的一种高度保守的细胞进程,该过程能很好的调整线粒体数目并维持细胞能量代谢的稳定。 在活性氧应激、营养缺乏、细胞衰老等作用下,细胞内的线粒体会出现去极化损伤...
通过分析线粒体DNA序列的变异,可以追溯人类的遗传谱系和人类群体的迁移历史。 因此,线粒体基因组测序以及对于其结构功能的研究有重要价值,迄今也已出现了许多涉及多物种的与线粒体有关的基因集的数据库,可以用来注释筛选线粒体相关基因,便于开展相应的线粒体进一步研究。下面我们来了解一部分常用的线粒体相关基因组...
2,技术层面:线粒体功能复杂,涉及基因数量巨大,能获得显著差异基因概率高。 小云今天找到1篇8分+分析线粒体基因与胃癌的文章,该文章并未将线粒体基因与细胞死亡进行关联,而是从肿瘤微环境、免疫浸润等角度来讨论线粒体基因的功能;同时,该文章列举出了2030个线粒体基因,可谓是最丰富的版本,为大家的分析提供了参考(...
线粒体相关基因集涵盖了与线粒体DNA、线粒体呼吸链、线粒体内外物质转运以及线粒体疾病发病机制等方面相关的基因。了解这些基因的结构和功能对于深入理解线粒体的生物学功能以及相关疾病的发生发展具有重要意义。同时,深入研究这些基因与线粒体疾病之间的关系,有助于为线粒体疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。©...
n数据库简介:MitoMiner是线粒体定位数据库,目前更新到v4.0版本,包含哺乳动物(人、小鼠)、酵母及斑马鱼的线粒体相关基因数据。MitoMiner存储了来自56项已发表的大规模GFP标记和质谱研究的实验性线粒体定位证据,来自iPSORT、MitoProt、TargetP和MitoFates的靶向序列预测,以及来自人类蛋白质图谱的免疫染色结果。数据库设计目...
线粒体基因与细胞的能量代谢密切相关,它们编码的蛋白质参与线粒体的结构和功能,从而影响身体的健康状况。 线粒体基因的一个重要特点是其遗传方式。与细胞核基因不同,线粒体基因是通过母系遗传的。也就是说,线粒体基因只能由母亲传给子女,而父亲无法将其传递给后代。这种遗传方式称为线粒体DNA的单亲遗传。由于...
因此，本研究旨在通过全面的生物信息学分析来探讨乳酸化相关基因表达与线粒体相关基因的关联，并识别在胃癌中具有预后意义的基因。作者以TCGA数据集作为主要训练集构建预后模型，随后使用多个GEO数据集进行验证以评估研究结果的稳健性和普适性；识别新的预后标志物和治疗靶点。通过应用scRNA-seq和空间转录组学等技术，剖析...
4. DEGs富集的KEGG通路以线粒体代谢与功能、缺氧与氧化还原反应、物质生成、免疫等通路为主(图3g-l)。二、DCM 中的线粒体相关DEGs 1. 在MitoCarta3.0数据库中检索线粒体相关基因，在3个数据集中选取与DEGs重叠的基因作为MitoDEGs（MitoCarta3.0数据库收录了1136个人类和1140个小鼠的蛋白编码基因，这些基因均...
MitoMiner最新发布v4.0版本,包含哺乳动物(人、小鼠)、酵母及斑马鱼的线粒体相关基因数据。数据库设计目的在于用于确认基因是否编码线粒体蛋白,并给出基因产物功能、可能的其他物种同源物、组织特异性表达信息、代谢注释信息、可能的人类疾病相关性信息和模式生物中基因表型等信息。...
二、DCM 中的线粒体相关DEGs 1. 在MitoCarta3.0数据库中检索线粒体相关基因,在3个数据集中选取与DEGs重叠的基因作为MitoDEGs(MitoCarta3.0数据库收录了1136个人类和1140个小鼠的蛋白编码基因,这些基因均定位在线粒体定位上)。GSE4745数据集有32个 (15个上调,17个下调), GSE5606数据集有34个 (18个上调,16个下...