今天小编继续跟大家分享一个最近比较热门的基因集—线粒体自噬相关基因集 线粒体自噬(mitophagy)是真核细胞通过自噬机制选择性清除功能失调或者多余线粒体的一种高度保守的细胞进程,该过程能很好的调整线粒体数目并维持细胞能量代谢的稳定。 在活性氧应激、营养缺乏、细胞衰老等作用下,细胞内的线粒体会出现去极化损伤,线粒体外膜电位丧
通过对MM患者和健康对照组的转录组数据进行分析,识别出差异表达基因(DEGs),并筛选出与线粒体相关基因(MRGs)和程序性细胞死亡相关基因(PCDRGs)的候选基因。通过单变量Cox回归、LASSO回归、多变量Cox回归和逐步回归分析,确定了7个预后基因(TRIAP1、TOMM7、PINK1、CHCHD10、PPIF、BCL2L1和NDUFA13)。基于这些基因构建...
线粒体功能相关基因 线粒体功能相关基因 线粒体作为细胞的能量工厂，其功能实现依赖于基因组与核基因组的协同调控。线粒体DNA（mtDNA）呈环状双链结构，全长约16.5kb，包含37个基因，编码13种氧化磷酸化复合物亚基、22种tRNA和2种rRNA。ND1-ND6、ND4L基因编码NADH脱氢酶复合物组分，COX1-COX3编码细胞色素c氧化...
这些基因分布在细胞核与线粒体自身,通过精密协作完成线粒体DNA复制、膜结构形成、电子传递链组装等核心任务。 核基因组中的PPARGC1A基因(俗称PGC-1α)是总指挥,激活NRF-1、NRF-2等下游调控因子。NRF-1负责指挥TFAM基因生产线粒体DNA包装蛋白,就像给遗传信息穿上防护服。NRF-2则调控COX系列基因,确保细胞色素C...
基于TCGA和GEO数据库中的STAD表达谱及芯片数据,利用“limma”包获得差异表达基因(DEGs);将DEGs与线粒体相关基因取交集,获得2031个差异表达的线粒体基因;通过单变量Cox回归、Lasso回归分析和多变量Cox回归分析筛选线粒体相关基因,构建新的预后相关基因集,利用基因集将患者分为高风险组和低风险组;对高/低风险组患者的...
n数据库简介:MitoMiner是线粒体定位数据库,目前更新到v4.0版本,包含哺乳动物(人、小鼠)、酵母及斑马鱼的线粒体相关基因数据。MitoMiner存储了来自56项已发表的大规模GFP标记和质谱研究的实验性线粒体定位证据,来自iPSORT、MitoProt、TargetP和MitoFates的靶向序列预测,以及来自人类蛋白质图谱的免疫染色结果。数据库设计目...
PLOG基因位于15号染色体q26.1区段,由23个外显子组成,22个外显子编码蛋白质,共1239个氨基酸(转录本NM_002693.3)。基因编码DNA聚合酶催化亚基,是线粒体DNA聚合酶异三聚体的组成部分。人群生育风险及常见致病变异PLOG基因缺陷导致多种线粒体相关疾病:常染色体隐性遗传的线...
线粒体基因与细胞的能量代谢密切相关,它们编码的蛋白质参与线粒体的结构和功能,从而影响身体的健康状况。 线粒体基因的一个重要特点是其遗传方式。与细胞核基因不同,线粒体基因是通过母系遗传的。也就是说,线粒体基因只能由母亲传给子女,而父亲无法将其传递给后代。这种遗传方式称为线粒体DNA的单亲遗传。由于...
1.线粒体DNA（mtDNA）基因集 线粒体DNA是线粒体内部的一个环状分子，其中包含有37个编码蛋白质、2个rRNA基因和22个tRNA基因。这些基因编码的蛋白质和RNA是线粒体的重要组成部分，其中编码蛋白质在线粒体呼吸链和能量代谢中起关键作用。参考内容：- Alberts B, et al. Molecular Biology of the Cell. 4th ...
线粒体在AD的发病机制中起着重要作用,鉴于AD病程中线粒体活性异常,所以挖掘新的关键线粒体相关基因至关重要。在这项研究中,作者将蛋白质-蛋白质相互作用(PPI) 网络分析和机器学习算法的结合分析,根据GEO数据库的转录组表达矩阵鉴定线粒体相关差异表达基因(MitoDEGs)。并构建诊断模型以及验证其诊断效能。MitoDEGs...