以下是三种常用的验证方法: 细胞分选验证 🧬 这种方法基于膜表面标记,利用流式细胞术对特定细胞进行分选。随后,通过RT-qPCR检测靶基因的表达,以验证新细胞群或靶基因在特定细胞群中的表达情况。 体外/体内细胞功能实验 🧬🐀 通过生物源性分析,探索筛选出的特定细胞群体中关键基因的分子功能或分子调控机制。主要方法...
今天给大家介绍一篇2023年1月发表在International Journal of Biological Sciences（IF=10.75）杂志上，题目为《 Validation of ESM1 Related to Ovarian Cancer and the Biological Function and Prognostic Significance 》，本篇文章结合生信分析和实验，从筛选到验证，得到了与OC的发生、发展密切相关的，有望成为OC新...
另外,该刊对于采用低通量的实验技术(采取试验对象是细胞,临床样本或者动物,技术方法也是简单的qRT-PCR或者IHC)去验证高通量的生信数据挖掘的结果的“生信分析+简单实验验证”套路文章也是接收的。例如: 2022年1月最新发表一篇“生信分析+简单实验验证”套路文章,题为:Bioinformatics analysis and identification of hub ge...
ESM1在OC的发展中的作用进行了探讨,在体内和体外的几个功能实验。通过生物信息学和实验分析,进一步阐明了ESM1的分子机制。 结果:ESM1在OC中显著上调,与PFS呈正相关,与OS呈负相关。在多个实验中,ESM1敲低抑制细胞增殖、凋亡逃逸、细胞周期、血管生成、迁移和侵袭。此外,GSVA发现ESM1与Akt通路相关,我们的结果支持这...
【生信+实验验证最好的思路是:单基因】 文章的题目是:Identification of AUNIP as a candidate diagnostic and prognostic biomarker for oral squamouscell carcinoma. 下面,和大家一起分解作者的套路: 一、研究材料 临床样本 包含89个口腔鳞状细胞癌(OSCC)样本和16个正常对照样本(癌旁组织) 组织微阵列芯片。另外是...
ESM1在OC的发展中的作用进行了探讨,在体内和体外的几个功能实验。通过生物信息学和实验分析,进一步阐明了ESM1的分子机制。 结果:ESM1在OC中显著上调,与PFS呈正相关,与OS呈负相关。在多个实验中,ESM1敲低抑制细胞增殖、凋亡逃逸、细胞周期、血管生成、迁移和侵袭。此外,GSVA发现ESM1与Akt通路相关,我们的结果支持...
5. 验证pSS和PD中的STING通路 基于RNA-seq数据对pSS患者中与STING通路相关四个基因进行验证。结果表明，STING1、IRF3、CXCL10和TRIM21在pSS中的表达明显增加。STING和IRF3的IHC染色显示，它们在pSS上皮细胞和淋巴细胞中的表达明显增加。为进一步验证PD中STING通路过程，对SN组织分离进行snRNA-seq分析。结果表明，STING...
使用ITGB1 siRNA 验证ITGB1的枢纽功能。比较实验组和对照组小鼠的疤痕总面积。接受克唑替尼、索拉非尼、SU11274 和 ITGB1 siRNA治疗的小鼠的疤痕面积均显著减少。然而,克唑替尼的抑制作用(图5a)。疤痕隆起通过血红素和伊红染色进行评估。疤痕隆起指数定义为 “D/d ”比值,“D”代表疤痕的厚度,“d”代表邻近正常...
生信是一种高通量RNA-seq,相当于一个未经过验证的批量实验,相对qPCR或者Western Blot一次只能检测一些基因或者蛋白的表达量而言,生信的准确度确实不如qPCR或者WB的。这是生信本身高通量的性质决定的,无法避免。如果抛开这个问题,哪些可能的原因会导致验证结果不一致呢?
伤口愈合实验表明,在 ESM1 KD 后,来自 OC 细胞的 CM 中 HUVEC 的迁移能力显着降低。增殖测定还表明,与 NC 和 Vector 组相比,具有源自 ESM1 KD OC 细胞的 CM 的 HUVECS 具有较低的增殖能力。此外,利用CAM分析进一步证实ESM1对OC体内血管生成的分子作用,与NC和Vector组相比,ESM1 KD的新血管形成密度明显降低...