1) 从课题延续性的角度来看,qPCR验证实验可以验证基因表达,并且有助于筛选下一步实验/分析所需基因 2) 从选择期刊投稿的角度来看,纯生信补PCR验证就有非常大的意义,因为你有了更多的期刊可以选择,投稿命中的机会就大大增加,这样的纯生信更容易被接收。有时候你距离5分+SCI就差一个qPCR验证,甚至有些期刊直接用补...
CCK-8分析表明,沉默DPH6-DT可显著提高细胞活力(图7B),EdU分析表明,DPH-6DT缺乏可显著增加IHH-4和KTC-1细胞中PTC细胞的增殖(图7C)。同样,当DPH6-DT沉默时,入侵和迁移增强(图7D)。此外,作者还探究了PTC中DPH6-DT-敲除的潜在机制变化。Western blot分析显示,缺失DPH6-DT可增加IHH-4和KTC-1细胞中AKT、p-A...
由于ACTA2和FAP是众所周知的CAFs标记物,因此利用GEPIA2数据库分析了CAFs标记物(ACTA2和FAP)与缺氧相关预后面板(包括APOD、POSTN、BMP4、MXRA5和LBH)之间的相关性。 4.临床病理特征分析和模型构建 根据LASSO-Cox 回归分析结果,利用基因表达和系数计算缺氧评分。根据缺氧评分的中位数,TCGA-GC 患者被分为高低两组。...
四、测试队列中预后模型的验证 与高风险组的患者相比,低风险组患者的死亡率更低,OS时间更长,这表明较低的风险评分与更好的预后有关(图4A)。此外,Kaplan-Meier生存分析还表明,不同风险组的患者具有不同的预后,这与训练队列的结果一致(图4B)。最后,时间依赖的ROC曲线表明,OS的预后准确性在1年为0.560,5年为0.57...
不要只盯着药敏性分析啦!不妨试着搭配机器学习算法,外加简单验证实验,四张图也能轻松拿下5.5分+! 众所周知,肿瘤占据着生信话题的C位! 因为肿瘤的生信挖掘研究有很多优点:可用数据多、数据类型丰富、临床信息完整、分析角度多样等等。 而在肿瘤常规预后模型的生信文章中,总是有这么一个小章节,简单讲述着化疗药物的...
为何要加实验验证❓生信菜鸟听完恍然大悟😮 #医学 #医学生 #生信 #生信分析 #科研 - 统计之光于20240725发布在抖音,已经收获了21.0万个喜欢,来抖音,记录美好生活!
注:简单验证实验一般包括qPCR、WB、IHC验证基因表达(临床样本、细胞样本等);中等验证实验一般会做到细胞实验,在干扰/过表达某关键基因后,验证其功能,有些也会做简单的通路蛋白表达验证(比较少);更复杂的验证实验会做一些动物模型(更多是非肿瘤疾病),在动物模型中研究基因功能。
其次,建立了一个基于单变量Cox和LASSO Cox回归分析的预测模型,该模型在GSE65904的测试队列中得到了验证。第三,使用诺莫图来预测SKCM患者的生存概率。R包“pRRophetic”用于识别低风险和高风险群体之间的药物敏感性。最后,在A375和A2058细胞中探索了GSDMD和SB525334的功能。
今天给同学们分享一篇单细胞分析+实验验证的生信文章“Construction of a hypoxia-immune-related prognostic panel based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses in gastric cancer”,这篇文章于2023年4月26日发表在Front Immunol 期刊上,影响因子为7.3。
今天给同学们分享一篇单细胞分析+实验验证的生信文章“Construction of a hypoxia-immune-related prognostic panel based on integrated single-cell and bulk RNA sequencing analyses in gastric cancer”,这篇文章于2023年4月26日发表在Front Immunol 期刊上,影响因子为7.3。