Elevated TOP2A and UBE2C expressions correlate with poor prognosis in patients with surgically resected lung adenocarcinoma: a study based on immunohistochemical analysis and bioinformaticsTOP2A和UBE2C表达升高与肺腺癌手术切除患者预后不良有关：一项基于免疫组化分析和生信的研究一、研究背景 肺癌是发病率和死亡...
作者对34例HCC组织切片和正常组织进行免疫组化。结果表明,在肿瘤组织中3个MVIRGs的蛋白表达水平较高(图6A-6C)。156例样本的qRT-PCR结果表明,3个MVIRGs的表达水平在肿瘤组织中更高(图6D)。对随访数据的分析表明,高表达组的RFS和OS较差(图6E)。MVIRGs在MVI阳性样本中的表达水平较高(图6F),且风险打分较高(图6...
在NGS时代,免疫基因组学不仅包括免疫细胞的全局图谱,还包括通过异常肽预测,HLA分型和MHC-肽结合亲和力预测免疫原蛋白。 1.1 TIME的免疫细胞定量研究肿瘤免疫微环境(TIME)由各种免疫细胞组成。以往的肿瘤免疫细胞组成研究中,传统的流式细胞技术和免疫组化(IHC)方法由于成本高和组织可得性低无法进行大规模分析。基于NGS技...
AQP9、CD27和HVCN1分别是γδT细胞、活化B细胞和未成熟B细胞的细胞标记,与非炎症组织相比,这些免疫细胞的数量在CD组织中均有所增加。 进一步研究了CD中AQP9、CD27和HVCN1与28个免疫细胞的相关性:如表2所示,AQP9与活化的CD4 T细胞、活化的CD8 T细胞、活化的树突状细胞、巨噬细胞、调节性T细胞、17型辅助性T细胞...
其实免疫组化(IHC)技术的主要作用就是进行肿瘤的诊断以及鉴别诊断,还有对肿瘤进行更为细化的分类。不同起源的肿瘤细胞虽然外表相似,但内在不一样,表达不同的蛋白质(抗原),所以我们可利用免疫组化技术,从蛋白水平把它们区别开来,从而做出正确的诊断。而把IHC与生信结合起来,放在实验验证部分,不同于司空见惯的动物...
1)免疫组化中的样品去糖基化 2)生存树分析模型:使用最小深度和可变重要性(VIMP)建立了生存树分析(STA)模型;采用Kaplan-Meier分析法对结点进行评估 3)体内异种移植肿瘤模式:小鼠实验 4)循环肿瘤细胞的分离、TILs的分离和分析 5)单细胞测序:GSE163872
在恶性细胞中,干扰素和MHC II在大多数肿瘤(75%)中偶联,但在其他肿瘤中没有偶联(图6d)。免疫组化显示了从偶联到解耦的恶性细胞的梯度,突出了这些状态在同一肿瘤中的共存(图6e)。 研究结果表明MHC II、干扰素反应和肺泡分化反映了在几种细胞类型和癌症类型中观察到的一致表达程序。MHC II的表达和干扰素应答对T细胞...
进一步用免疫组化染色比较LUAD和匹配的正常组织中TOP2A和UBE2C的表达。与GEO和TCGA的结果一致,TOP2A和UBE2C均高表达于肿瘤中(图7)。且TOP2A和UBE2C的表达与性别、吸烟、肿瘤长度、T期、N期、TNM分期等显著关联。 图7.LUAD TMA切片的代表性显微照片 9.NCC验证集:TOP2A和UBE2C表达的生存分析 作者最后在NCC...
免疫组化步骤(2)有关生信分析的任何问题,你都可以私信我~6.石蜡切片 切片厚度一般为4-5μm,展片可先放在5%-10%的乙醇内然后转移到恒温(40-46℃)水中。贴片后切片放满一抽,放入60-65℃烤箱中烤片20-30分钟,使得水分蒸发和石蜡熔化,取出即可进行染色。也可45℃烤片数小时,直至将蜡片水分烤干,烤片后的...
在之前的一项回顾性研究中，作者利用免疫组化检测了GC组织中CD34的表达，包括35个正常组织和375个肿瘤组织(图3A)。结果显示，与邻近正常组织相比，GC组织中CD34的表达明显上调(图3B和C)。此外，卡方检验和差异分析结果进一步表明，CD34高表达的患者临床分期更早，血管浸润明显增加(图3D和E)。 生存结果显示，CD34高...