ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)技术是一种利用Tn5转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术。染色质可及性,即染色质的开放程度,指的是细胞核内大分子能够与染色质中DNA发生物理接触的程度。Tn5酶倾向性地结合开放的染色质区域,ATAC-seq技术利用这种特性对开放的染...
本发明涉及一种适用于植物ATAC‑seq测序技术的文库构建方法,包括:1)制备植物单细胞悬液;2)Nuclei Extraction Buffer裂解细胞膜,获得细胞核并纯化;所述纯化方法为以下处理:依次经细胞核提纯缓冲液提纯细胞核、经细胞核分离缓冲液进行密度梯度离心分离细胞核;3)收集细胞核进行定量和细胞核完整性检测;4)完整细胞核中加...
进一步利用染色质开放性测序(ATAC-seq)和转录组测序(RNA-seq)技术挖掘出梅花冷锻炼调控耐寒性相关基因。与常温对照处理(CG,24℃)相比,RNA-seq分析发现梅花响应冷处理(CE,4℃)、冻处理(NF,–4℃)以及冷锻炼后冻处理(CF,先4℃再–4℃)基因整体表达水平存在差异,部分基因同时响应冷、冻以及冷锻炼后冻处理,其中9...
ATAC-seq的原理 ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)技术是一种利用Tn5转座酶研究染色质可及性的高通量测序技术。染色质可及性,即染色质的开放程度,指的是细胞核内大分子能够与染色质中DNA发生物理接触的程度。Tn5酶倾向性地结合开放的染色质区域,ATAC-seq技术利用这...
进一步利用染色质开放性测序(ATAC-seq)和转录组测序(RNA-seq)技术挖掘出梅花冷锻炼调控耐寒性相关基因。与常温对照处理(CG,24℃)相比,RNA-seq分析发现梅花响应冷处理(CE,4℃)、冻处理(NF,–4℃)以及冷锻炼后冻处理(CF,先4℃再–4℃)基因整体表达水平存在差异,部分基因同时响应冷、冻以及冷锻炼后冻处理,其中...