在转录组和代谢组联合分析中,转录组中的差异表达基因与代谢组检测到的差异代谢物进行关联分析,可以从原因和结果两个层次分析植物体内在变化,锁定与代谢物变化的重点通路,进而构建核心调控网络,从而揭示其内在规律。转录组与代谢组的关联分析方法主要包含以下内容:基于KEGG通路的注释和富集分析、基于皮尔逊的相关性分析和...
这些unique被分配到139条通路中,主要为是植物激素信号转导、RNA转运和植物-病原体等通路。KEGG分类中对其他次生代谢物的生物合成进行KEGG富集分析,发现与酚类化合物相关的79条代谢途径中富集了1235个unique,参与生物合成的unique有1067个。 值得注意的是,与酚类化合物生物合成相关的unigene表达水平在四种不同的组织中表...
转录组学代谢组学多组学联合分析逆境胁迫生长发育随着测序技术及质谱技术的发展,获得高通量的测序数据和质谱数据的方法越来越方便,系统生物学通过整合生物系统中诸多相互联系和作用的组分以研究复杂生物过程的机制.组学是基于高通量分析的系统生物学研究,依据研究对象可以分为基因组学,转录组学,蛋白质组学和代谢组学等,...